179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0417 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0417  PKD  100 
 
 
582 aa  1187    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  47.5 
 
 
626 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.44 
 
 
1236 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.1 
 
 
547 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.89 
 
 
735 aa  99.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  25.28 
 
 
838 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.05 
 
 
1282 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  29.28 
 
 
777 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  24.36 
 
 
1931 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  50 
 
 
1667 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  27.83 
 
 
940 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.06 
 
 
1862 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43 
 
 
1842 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  48.57 
 
 
930 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.72 
 
 
810 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  55 
 
 
1361 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.33 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  46.84 
 
 
1120 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  58.06 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  50.65 
 
 
752 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.67 
 
 
1682 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.49 
 
 
1667 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  43.82 
 
 
2272 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  47.83 
 
 
786 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  49.3 
 
 
1882 aa  73.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  50 
 
 
1094 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  45.33 
 
 
669 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  50 
 
 
679 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.87 
 
 
2122 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.89 
 
 
2000 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  54.1 
 
 
500 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  49.33 
 
 
615 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.5 
 
 
1969 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  47.5 
 
 
1380 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  55.36 
 
 
1042 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  44 
 
 
963 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  52.94 
 
 
2036 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  49.28 
 
 
859 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  52.94 
 
 
791 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  50 
 
 
575 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  43.9 
 
 
2554 aa  72  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  38.61 
 
 
211 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 
845 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  44 
 
 
675 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  44.93 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.68 
 
 
3295 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  48.57 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.28 
 
 
978 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.44 
 
 
930 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  47.14 
 
 
561 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  42.67 
 
 
713 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  50 
 
 
685 aa  70.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  52.94 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.33 
 
 
594 aa  70.5  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  50.77 
 
 
1531 aa  70.5  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  41.35 
 
 
560 aa  70.5  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  47.95 
 
 
581 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  46.27 
 
 
869 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  45.33 
 
 
910 aa  69.7  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1732 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 
1056 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  27.65 
 
 
960 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.38 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  44 
 
 
400 aa  70.1  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  48.33 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.89 
 
 
719 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  42.67 
 
 
941 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  56.9 
 
 
1528 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  51.47 
 
 
1241 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  49.18 
 
 
1300 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  58 
 
 
971 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 
802 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  39.62 
 
 
958 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  46.67 
 
 
2176 aa  67.4  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.21 
 
 
528 aa  67  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  54.55 
 
 
684 aa  67  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  44.62 
 
 
1231 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  29.61 
 
 
697 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  53.57 
 
 
530 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 
870 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  30.73 
 
 
698 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  42.35 
 
 
1189 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.31 
 
 
1356 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  44 
 
 
840 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  46.43 
 
 
567 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.11 
 
 
1387 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  43.84 
 
 
816 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.48 
 
 
819 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  45.45 
 
 
1001 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  51.67 
 
 
439 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  48.33 
 
 
848 aa  64.3  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  48.05 
 
 
1092 aa  63.9  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.67 
 
 
625 aa  63.9  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.470845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  40.86 
 
 
2552 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  47.22 
 
 
1783 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  30.15 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  40.96 
 
 
861 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
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NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  31.52 
 
 
810 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
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NC_007796  Mhun_2498  PKD  50.79 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
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