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for query gene Mhun_0644 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  100 
 
 
1092 aa  2222    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  41.37 
 
 
725 aa  343  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.36 
 
 
1236 aa  332  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  41.4 
 
 
475 aa  320  9e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  37.5 
 
 
497 aa  264  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  37.02 
 
 
2353 aa  251  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  38.04 
 
 
496 aa  249  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36.75 
 
 
777 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  40.16 
 
 
996 aa  177  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.83 
 
 
3295 aa  175  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.95 
 
 
547 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  36.47 
 
 
1042 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.79 
 
 
735 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  38 
 
 
941 aa  161  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  38.38 
 
 
1056 aa  155  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  37.4 
 
 
1231 aa  155  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.6 
 
 
838 aa  145  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  40.68 
 
 
1931 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  38.93 
 
 
810 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  43.09 
 
 
1001 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.53 
 
 
940 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.65 
 
 
505 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  31.27 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1944  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.75 
 
 
638 aa  127  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  27.96 
 
 
571 aa  127  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.74 
 
 
777 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.64 
 
 
865 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.85 
 
 
2272 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.4 
 
 
769 aa  118  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.23 
 
 
1969 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  37.5 
 
 
616 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.29 
 
 
635 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.81 
 
 
2036 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.55 
 
 
375 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  33.54 
 
 
218 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.59 
 
 
1300 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  46.03 
 
 
433 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.46 
 
 
871 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  35.54 
 
 
778 aa  107  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1059  hypothetical protein  34.76 
 
 
867 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.724873  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  41.38 
 
 
960 aa  105  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.31 
 
 
595 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  49.06 
 
 
1667 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  45.65 
 
 
1862 aa  99  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  42.64 
 
 
1361 aa  98.6  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.9 
 
 
752 aa  98.2  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  29.55 
 
 
1292 aa  96.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  32.2 
 
 
810 aa  95.5  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  48.15 
 
 
644 aa  95.1  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.46 
 
 
2554 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  38.67 
 
 
1094 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.38 
 
 
1842 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  36.84 
 
 
859 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  36.04 
 
 
641 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  32.03 
 
 
564 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.07 
 
 
575 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  47.75 
 
 
1120 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  49.02 
 
 
551 aa  92.8  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  40.74 
 
 
1282 aa  92.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  30.11 
 
 
325 aa  92.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
602 aa  92  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.125341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  25.71 
 
 
2176 aa  92  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  34.65 
 
 
297 aa  92  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.1 
 
 
791 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  42.74 
 
 
1732 aa  91.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  51.28 
 
 
2000 aa  91.3  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.6 
 
 
713 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  37.75 
 
 
1882 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  36.54 
 
 
698 aa  90.9  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  48.94 
 
 
958 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.41 
 
 
561 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  49.44 
 
 
500 aa  89.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  58.23 
 
 
2122 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  31.51 
 
 
831 aa  89.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.43 
 
 
978 aa  89.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.31 
 
 
685 aa  89.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  37.33 
 
 
1682 aa  89.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.6 
 
 
560 aa  89  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  47.25 
 
 
669 aa  88.6  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  51.25 
 
 
675 aa  88.6  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  48.48 
 
 
184 aa  88.2  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  36.36 
 
 
805 aa  87.8  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 
1356 aa  87.8  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  50 
 
 
930 aa  87.8  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  47.87 
 
 
658 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.84 
 
 
679 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  44.44 
 
 
615 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.42 
 
 
1241 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.22 
 
 
870 aa  87  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_007796  Mhun_0970  PKD  47.92 
 
 
1528 aa  87  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  53.01 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.5 
 
 
910 aa  86.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.7 
 
 
719 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  50 
 
 
530 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.72 
 
 
963 aa  85.9  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  48.31 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
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NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  46.23 
 
 
802 aa  85.1  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
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NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.87 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
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NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
1121 aa  84.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
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NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50 
 
 
581 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
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