More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2670 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1387 aa  2703    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1667 aa  505  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.61 
 
 		 1094 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.32 
 
 		 2272 aa  466  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  39.52 
 
 		 1862 aa  465  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  36.12 
 
 		 1361 aa  458  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1682 aa  396  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44.83 
 
 		 930 aa  382  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1282 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  36.92 
 
 		 941 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.88 
 
 		 963 aa  352  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  29.64 
 
 		 1528 aa  352  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  42.8 
 
 		 1842 aa  337  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  43.35 
 
 		 978 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.32 
 
 		 1667 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40.73 
 
 		 561 aa  319  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  31.2 
 
 		 2176 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.08 
 
 		 752 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  41.5 
 
 		 1356 aa  305  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.52 
 
 		 1814 aa  300  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.7 
 
 		 735 aa  298  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.06 
 
 		 2036 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  43.38 
 
 		 1882 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.45 
 
 		 2122 aa  283  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.25 
 
 		 2554 aa  281  6e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.96 
 
 		 838 aa  281  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 528 aa  281  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.09 
 
 		 575 aa  279  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  46.27 
 
 		 859 aa  278  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.16 
 
 		 1236 aa  278  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  42.43 
 
 		 2000 aa  270  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  44.39 
 
 		 530 aa  266  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.74 
 
 		 1300 aa  261  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.05 
 
 		 713 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  33.48 
 
 		 1783 aa  260  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  43.65 
 
 		 669 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  45.4 
 
 		 685 aa  259  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  42.42 
 
 		 675 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.66 
 
 		 840 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  43.97 
 
 		 679 aa  253  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.3 
 
 		 1606 aa  253  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.45 
 
 		 845 aa  249  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.48 
 
 		 861 aa  249  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.47 
 
 		 870 aa  248  6.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.77 
 
 		 823 aa  247  9e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  46.3 
 
 		 460 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  45.63 
 
 		 1969 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  40.35 
 
 		 658 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.84 
 
 		 958 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.75 
 
 		 1120 aa  239  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  42.03 
 
 		 1241 aa  236  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.7 
 
 		 802 aa  229  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  39.37 
 
 		 777 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 786 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  29.94 
 
 		 1011 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  48.12 
 
 		 910 aa  212  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  43.09 
 
 		 581 aa  211  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  45.56 
 
 		 547 aa  211  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  29.86 
 
 		 952 aa  209  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50.76 
 
 		 1732 aa  207  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.53 
 
 		 551 aa  206  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  37.02 
 
 		 819 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.78 
 
 		 791 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.52 
 
 		 615 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.53 
 
 		 3295 aa  189  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.7 
 
 		 865 aa  187  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.24 
 
 		 1620 aa  186  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.55 
 
 		 869 aa  181  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  37.6 
 
 		 443 aa  176  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  35.66 
 
 		 1292 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.67 
 
 		 1602 aa  171  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  36.42 
 
 		 929 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  36.24 
 
 		 971 aa  168  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.47 
 
 		 930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  29.74 
 
 		 1531 aa  159  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.16 
 
 		 719 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  30.04 
 
 		 734 aa  152  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  39.93 
 
 		 2552 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.79 
 
 		 560 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  48 
 
 		 644 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.45 
 
 		 439 aa  144  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  40 
 
 		 1095 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  40 
 
 		 938 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  47.17 
 
 		 184 aa  141  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.78 
 
 		 1189 aa  138  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  40 
 
 		 821 aa  136  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  42.16 
 
 		 739 aa  133  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.73 
 
 		 1987 aa  133  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  44.1 
 
 		 519 aa  131  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  45.33 
 
 		 500 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  43.5 
 
 		 1931 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  42 
 
 		 996 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 966 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  38.61 
 
 		 816 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.03 
 
 		 1389 aa  126  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  38.98 
 
 		 400 aa  125  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 		 875 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  37.29 
 
 		 408 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  40.44 
 
 		 1231 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  36.52 
 
 		 930 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>