290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0638 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  100 
 
 
519 aa  952    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44.87 
 
 
460 aa  265  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  44.64 
 
 
859 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  43.22 
 
 
752 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  43.79 
 
 
1094 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.85 
 
 
1667 aa  239  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.98 
 
 
735 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  42.66 
 
 
561 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  44.83 
 
 
669 aa  236  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  44.38 
 
 
679 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.29 
 
 
1682 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  42.09 
 
 
575 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  45.38 
 
 
675 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.53 
 
 
1236 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  43.01 
 
 
2272 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  42.7 
 
 
1882 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.94 
 
 
685 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.73 
 
 
2036 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.98 
 
 
1842 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  41.69 
 
 
713 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.27 
 
 
1300 aa  223  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  42.05 
 
 
2122 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  40.05 
 
 
978 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  44.22 
 
 
658 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.8 
 
 
1120 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  43.62 
 
 
963 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  40.71 
 
 
2000 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.02 
 
 
1356 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  42.78 
 
 
528 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  42.03 
 
 
1969 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.61 
 
 
1862 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.9 
 
 
1241 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.44 
 
 
1361 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.94 
 
 
2554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.74 
 
 
530 aa  199  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  37.23 
 
 
941 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.84 
 
 
958 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  56.71 
 
 
184 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  51.04 
 
 
615 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  41.98 
 
 
791 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  35.96 
 
 
1282 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  52.13 
 
 
581 aa  180  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  50.54 
 
 
551 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  41.85 
 
 
1667 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.46 
 
 
861 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.73 
 
 
3295 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  54.88 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  55.31 
 
 
1732 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  56.17 
 
 
560 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.09 
 
 
644 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.7 
 
 
838 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.02 
 
 
1528 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  54.01 
 
 
910 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.68 
 
 
1387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.04 
 
 
869 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  38.84 
 
 
930 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  39.61 
 
 
1783 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  50.8 
 
 
996 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  47.53 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  43.72 
 
 
1328 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 
840 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.46 
 
 
1531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  43.43 
 
 
769 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  47.2 
 
 
1931 aa  139  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  48.35 
 
 
930 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  45.05 
 
 
439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.19 
 
 
816 aa  136  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  45.7 
 
 
1231 aa  134  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  51.41 
 
 
719 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  32.85 
 
 
1814 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  32.51 
 
 
1292 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.18 
 
 
848 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  49.3 
 
 
845 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  32.11 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  48.59 
 
 
802 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.36 
 
 
952 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.02 
 
 
1011 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  45.96 
 
 
870 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  46.54 
 
 
684 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  35.64 
 
 
823 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  47.24 
 
 
971 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  44.69 
 
 
777 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  45.4 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 
786 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  31.18 
 
 
929 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.84 
 
 
2552 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.34 
 
 
819 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  44.51 
 
 
1095 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.91 
 
 
1311 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  32.02 
 
 
2176 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  41.01 
 
 
408 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  44.65 
 
 
940 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  40.44 
 
 
819 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.82 
 
 
1380 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.98 
 
 
865 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 
1606 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  41.97 
 
 
586 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40 
 
 
1189 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.08 
 
 
821 aa  98.2  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  40.88 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.644592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>