More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2204 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 838 aa  1693    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.76 
 
 		 735 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  43.86 
 
 		 1094 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  41.89 
 
 		 1862 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  42.73 
 
 		 1667 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.93 
 
 		 1282 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.95 
 
 		 1682 aa  385  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.7 
 
 		 1842 aa  382  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.96 
 
 		 978 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.88 
 
 		 1361 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  42.33 
 
 		 963 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 1356 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.18 
 
 		 2272 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.17 
 
 		 528 aa  353  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  44.2 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.81 
 
 		 752 aa  342  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  39.93 
 
 		 941 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.46 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  41.56 
 
 		 1882 aa  333  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40.62 
 
 		 2036 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.82 
 
 		 930 aa  324  4e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.63 
 
 		 530 aa  321  3.9999999999999996e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.72 
 
 		 2000 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.96 
 
 		 2122 aa  313  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  42.51 
 
 		 859 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  49.54 
 
 		 679 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  41.93 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  49.85 
 
 		 669 aa  301  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.91 
 
 		 1236 aa  296  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.35 
 
 		 1528 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.26 
 
 		 777 aa  293  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  49.24 
 
 		 675 aa  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  49.24 
 
 		 685 aa  290  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.34 
 
 		 1667 aa  290  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.62 
 
 		 2554 aa  287  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  47.42 
 
 		 713 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  39.32 
 
 		 958 aa  280  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  48.8 
 
 		 658 aa  279  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.08 
 
 		 1732 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  42.71 
 
 		 1300 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.48 
 
 		 1387 aa  272  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44 
 
 		 460 aa  271  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.3 
 
 		 1120 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  44.29 
 
 		 1969 aa  260  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  42.51 
 
 		 1241 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  50 
 
 		 551 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  49.8 
 
 		 615 aa  243  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41.93 
 
 		 861 aa  241  5.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  46.3 
 
 		 910 aa  240  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50.4 
 
 		 581 aa  240  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.79 
 
 		 3295 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38.24 
 
 		 791 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.22 
 
 		 1011 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  32.46 
 
 		 2176 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  32.97 
 
 		 1814 aa  208  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.63 
 
 		 869 aa  207  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  30.31 
 
 		 952 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  41.73 
 
 		 461 aa  197  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  40.92 
 
 		 971 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.76 
 
 		 840 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 870 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  35.76 
 
 		 1931 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 		 845 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 823 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.57 
 
 		 719 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  36.08 
 
 		 439 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  37.59 
 
 		 443 aa  183  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  32.35 
 
 		 1783 aa  181  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 786 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.62 
 
 		 1056 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  35.06 
 
 		 802 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.44 
 
 		 930 aa  177  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.12 
 
 		 1620 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  37.87 
 
 		 1035 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.4 
 
 		 819 aa  171  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  36.63 
 
 		 940 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.1 
 
 		 2552 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  34.53 
 
 		 1292 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  50.31 
 
 		 560 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1001 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  49.4 
 
 		 644 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.84 
 
 		 865 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.58 
 
 		 960 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  42.08 
 
 		 1095 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  52 
 
 		 184 aa  157  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.74 
 
 		 519 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  31.47 
 
 		 929 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  41 
 
 		 821 aa  149  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  38.17 
 
 		 749 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.71 
 
 		 1531 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  28.35 
 
 		 1602 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.68 
 
 		 1092 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.86 
 
 		 938 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  35.86 
 
 		 1189 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  27.74 
 
 		 1606 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  31.07 
 
 		 1380 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  43.83 
 
 		 500 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  39.02 
 
 		 408 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  44.28 
 
 		 996 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.92 
 
 		 810 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>