More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2071 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1380 aa  2734    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  77.82 
 
 		 1356 aa  671    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  73.51 
 
 		 1732 aa  713    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  68.96 
 
 		 2554 aa  710    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  70.21 
 
 		 3295 aa  629  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  49.45 
 
 		 870 aa  492  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.96 
 
 		 840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.88 
 
 		 777 aa  342  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  40.67 
 
 		 819 aa  329  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.12 
 
 		 786 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.09 
 
 		 823 aa  286  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  83.87 
 
 		 802 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 845 aa  274  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  77.56 
 
 		 719 aa  262  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  58.26 
 
 		 848 aa  198  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.29 
 
 		 752 aa  193  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  31.17 
 
 		 2272 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.54 
 
 		 735 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1282 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.31 
 
 		 1387 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.82 
 
 		 675 aa  183  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 966 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.4 
 
 		 1094 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.56 
 
 		 679 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1682 aa  182  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  30.5 
 
 		 859 aa  178  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.46 
 
 		 561 aa  178  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.8 
 
 		 669 aa  178  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.25 
 
 		 2122 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  30.79 
 
 		 575 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  37.61 
 
 		 713 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.93 
 
 		 1842 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  36 
 
 		 2000 aa  175  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  37.04 
 
 		 685 aa  174  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.54 
 
 		 2036 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.42 
 
 		 1882 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.42 
 
 		 978 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.47 
 
 		 581 aa  172  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  30.84 
 
 		 1300 aa  171  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  37.23 
 
 		 1120 aa  171  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.31 
 
 		 1241 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.05 
 
 		 963 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.16 
 
 		 658 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  31.14 
 
 		 528 aa  169  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.13 
 
 		 930 aa  169  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.83 
 
 		 861 aa  169  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.39 
 
 		 910 aa  168  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.72 
 
 		 1862 aa  165  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  54.86 
 
 		 735 aa  164  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.11 
 
 		 1969 aa  162  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.19 
 
 		 547 aa  161  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.8 
 
 		 1361 aa  159  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.25 
 
 		 615 aa  159  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.64 
 
 		 551 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  47.87 
 
 		 627 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.13 
 
 		 1236 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  33.94 
 
 		 791 aa  152  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  53.79 
 
 		 1799 aa  152  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  47.46 
 
 		 581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  42.16 
 
 		 184 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  49.07 
 
 		 1234 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1667 aa  148  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.77 
 
 		 1667 aa  147  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  29.7 
 
 		 941 aa  147  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.68 
 
 		 838 aa  145  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  47.59 
 
 		 522 aa  142  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.66 
 
 		 460 aa  141  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  51.41 
 
 		 1262 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  29.67 
 
 		 530 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  54.55 
 
 		 954 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  55.3 
 
 		 930 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  39.62 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  28.7 
 
 		 1528 aa  133  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  32.8 
 
 		 2552 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40 
 
 		 644 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  51.03 
 
 		 1035 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  46.58 
 
 		 919 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  47.92 
 
 		 468 aa  125  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  37.93 
 
 		 930 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45.83 
 
 		 801 aa  123  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  33.23 
 
 		 439 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  33.73 
 
 		 1783 aa  121  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  31.76 
 
 		 958 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  40.12 
 
 		 875 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  45.78 
 
 		 627 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  35.07 
 
 		 500 aa  115  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.4 
 
 		 1295 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  37.16 
 
 		 1231 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.45 
 
 		 933 aa  113  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  37.5 
 
 		 1328 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  35.82 
 
 		 519 aa  111  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  31.19 
 
 		 816 aa  111  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  39.79 
 
 		 940 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  43.97 
 
 		 630 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  30.57 
 
 		 1095 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  46.92 
 
 		 739 aa  110  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  41.55 
 
 		 855 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  42.36 
 
 		 1024 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.32 
 
 		 1931 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  32.73 
 
 		 400 aa  107  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>