270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0755 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 627 aa  1258    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  53.58 
 
 		 831 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  49.3 
 
 		 579 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  52.61 
 
 		 930 aa  302  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  49.01 
 
 		 676 aa  296  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  48.15 
 
 		 668 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  49.83 
 
 		 709 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  49.83 
 
 		 346 aa  277  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50.77 
 
 		 343 aa  275  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  47.72 
 
 		 930 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  49.1 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  48.44 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  42.7 
 
 		 522 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.51 
 
 		 752 aa  250  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  38.87 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  41.38 
 
 		 1293 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  39.93 
 
 		 588 aa  226  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  42.86 
 
 		 491 aa  223  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  50.8 
 
 		 954 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  40.91 
 
 		 391 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.14 
 
 		 786 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  34.26 
 
 		 525 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.43 
 
 		 2296 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  35.44 
 
 		 319 aa  160  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  37.1 
 
 		 1079 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 439 aa  153  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  31.61 
 
 		 307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1068 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.78 
 
 		 1146 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 		 353 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.12 
 
 		 1163 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  32.92 
 
 		 646 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  48.17 
 
 		 1799 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.58 
 
 		 963 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  33.55 
 
 		 1140 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 966 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  46.75 
 
 		 845 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 		 802 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.45 
 
 		 870 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.09 
 
 		 823 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.07 
 
 		 903 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  42.7 
 
 		 919 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.96 
 
 		 1356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1030 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1750 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 		 343 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1051 aa  127  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.75 
 
 		 1030 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 		 850 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  48 
 
 		 1380 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.75 
 
 		 819 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1351 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.79 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.74 
 
 		 840 aa  123  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.75 
 
 		 1732 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.68 
 
 		 343 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.05 
 
 		 719 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  39.9 
 
 		 930 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  41.45 
 
 		 1234 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 627 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.97 
 
 		 1130 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.21 
 
 		 1292 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  41.36 
 
 		 875 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  45.39 
 
 		 1035 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  43.93 
 
 		 581 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  40.45 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1026 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.16 
 
 		 2554 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 		 379 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  63.95 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  45.27 
 
 		 749 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.82 
 
 		 1387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.38 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.86 
 
 		 3295 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  35.24 
 
 		 355 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  44.38 
 
 		 468 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  40.26 
 
 		 735 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 		 1262 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  29.04 
 
 		 448 aa  110  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  44.81 
 
 		 739 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  35.34 
 
 		 365 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1763 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  28.84 
 
 		 347 aa  107  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 772 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  55.06 
 
 		 877 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.91 
 
 		 899 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 		 363 aa  103  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.36 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  33.17 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28.67 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.75 
 
 		 373 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 418 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  36.73 
 
 		 664 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 447 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  26.55 
 
 		 372 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.14 
 
 		 361 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.66 
 
 		 321 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.77 
 
 		 693 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>