236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2618 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  72.38 
 
 
1234 aa  669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
522 aa  1059    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  44.05 
 
 
468 aa  365  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  59.11 
 
 
749 aa  250  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  53.53 
 
 
828 aa  240  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  47.31 
 
 
581 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  54.77 
 
 
378 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  46.61 
 
 
576 aa  217  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  43.71 
 
 
627 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  44.15 
 
 
735 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  43.42 
 
 
919 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  44.72 
 
 
329 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  41.41 
 
 
1262 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  39.75 
 
 
353 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42.73 
 
 
366 aa  156  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  37.99 
 
 
374 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  51.39 
 
 
1380 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  48.43 
 
 
802 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  50.72 
 
 
1799 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  47.3 
 
 
1732 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.97 
 
 
2554 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  48.32 
 
 
870 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 
930 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
845 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  46.84 
 
 
823 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  36.92 
 
 
374 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  47.17 
 
 
777 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  48.03 
 
 
1356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  46.71 
 
 
3295 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  47.02 
 
 
819 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  37.5 
 
 
358 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 
840 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  47.3 
 
 
719 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  70.73 
 
 
930 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  58.88 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  72 
 
 
488 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  66.67 
 
 
579 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  78.87 
 
 
676 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  59.41 
 
 
668 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  45.96 
 
 
954 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  37.67 
 
 
255 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  36.82 
 
 
966 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.31 
 
 
786 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  65.12 
 
 
787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  46.02 
 
 
1035 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.33 
 
 
368 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  61.45 
 
 
848 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  68 
 
 
479 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.76 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3163  lipolytic protein G-D-S-L family  34.53 
 
 
241 aa  113  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  53.15 
 
 
958 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.59 
 
 
875 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2395  lipolytic protein G-D-S-L family  35.62 
 
 
311 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00016801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  67.61 
 
 
831 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  48.41 
 
 
869 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  32.74 
 
 
253 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  66.67 
 
 
294 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  63.29 
 
 
522 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  70 
 
 
709 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  66.23 
 
 
298 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  61.25 
 
 
391 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  60 
 
 
390 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  43.17 
 
 
403 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  48.33 
 
 
1056 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.79 
 
 
1387 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  41.1 
 
 
627 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  31.3 
 
 
681 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  45.6 
 
 
561 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  46.38 
 
 
343 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  34.1 
 
 
349 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4057  hypothetical protein  31.4 
 
 
261 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  62.67 
 
 
110 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  41.55 
 
 
630 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  68.12 
 
 
361 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  40 
 
 
855 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40.97 
 
 
801 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  38.93 
 
 
739 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.87 
 
 
933 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.56 
 
 
547 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.14 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  56.16 
 
 
697 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  27.31 
 
 
759 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.46 
 
 
1024 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  51.35 
 
 
433 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  54.79 
 
 
698 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  26.94 
 
 
612 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.16 
 
 
1004 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  30.09 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.1 
 
 
500 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 
918 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  50.68 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.03 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  37.58 
 
 
1167 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.73 
 
 
550 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  37.59 
 
 
479 aa  84  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  36.42 
 
 
948 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.26 
 
 
1321 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  37.21 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.26 
 
 
1338 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.43 
 
 
982 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>