32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1080 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 518 aa  1028    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  86.85 
 
 		 524 aa  856    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  43.17 
 
 		 790 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  61.11 
 
 		 873 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  60.81 
 
 		 1024 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  54.93 
 
 		 1482 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  53.33 
 
 		 717 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  55.71 
 
 		 1314 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  50.63 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  51.43 
 
 		 679 aa  73.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  31.87 
 
 		 1236 aa  70.9  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  48.65 
 
 		 2082 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  52.86 
 
 		 1189 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  52.05 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  43.66 
 
 		 1814 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  32.62 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  45.21 
 
 		 1017 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  40.85 
 
 		 724 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  33.54 
 
 		 1067 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  32.21 
 
 		 486 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  42.19 
 
 		 101 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  27.54 
 
 		 486 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1406 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1321 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.28 
 
 		 3802 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 1184 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  30.6 
 
 		 885 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  35.96 
 
 		 900 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  37.84 
 
 		 1199 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.8 
 
 		 892 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  40.32 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>