18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3967 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  95.38 
 
 		 486 aa  924    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 486 aa  989    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  52.11 
 
 		 892 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.24 
 
 		 2031 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  36.11 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  45 
 
 		 1067 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  36.19 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  35 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  35.35 
 
 		 1047 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  31.15 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  43.66 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  29.63 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  45.83 
 
 		 1219 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  31.97 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  30.99 
 
 		 864 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 696 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3974  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372052  normal  0.856293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>