36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3181 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 524 aa  1048    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  86.07 
 
 		 518 aa  836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  48.31 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  43.71 
 
 		 790 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  55.32 
 
 		 1024 aa  90.5  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  48.31 
 
 		 873 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  54.79 
 
 		 1482 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  52.56 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  51.9 
 
 		 646 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  52.86 
 
 		 1314 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  46.75 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.13 
 
 		 1189 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 2082 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  44 
 
 		 1814 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.68 
 
 		 607 aa  67  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  31.94 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.32 
 
 		 1236 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  46.58 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  40.85 
 
 		 724 aa  60.1  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.4 
 
 		 1067 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0952  fibronectin, type III domain-containing protein  32.62 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3967  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.476574  normal  0.587814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  40.28 
 
 		 1321 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1406 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 		 1184 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  38.74 
 
 		 1199 aa  51.2  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  35.71 
 
 		 3802 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  30.63 
 
 		 885 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  38.71 
 
 		 101 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  35.59 
 
 		 900 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  38.89 
 
 		 1887 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  41.33 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  42.62 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.18 
 
 		 892 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.28 
 
 		 903 aa  43.5  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  30.77 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>