40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2918 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1758    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  53.7 
 
 		 1024 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  58.04 
 
 		 1482 aa  154  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  42.47 
 
 		 646 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1314 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0220  hypothetical protein  32.98 
 
 		 534 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.175464  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0221  hypothetical protein  34.7 
 
 		 535 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00277701  normal  0.0427708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  44.97 
 
 		 1189 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  42.68 
 
 		 1814 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  32 
 
 		 1236 aa  95.9  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  63.38 
 
 		 489 aa  92  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  51.58 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  43.75 
 
 		 2233 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  57.14 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  50 
 
 		 2082 aa  78.2  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45 
 
 		 979 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  48.48 
 
 		 717 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  30.95 
 
 		 2004 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1017 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 524 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.29 
 
 		 607 aa  62  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  47.14 
 
 		 1321 aa  61.6  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  47.14 
 
 		 724 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38 
 
 		 984 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2024  hypothetical protein  41.79 
 
 		 101 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.474251 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  22.42 
 
 		 857 aa  52.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1601 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  32.89 
 
 		 767 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  43.55 
 
 		 1184 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 		 966 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  32.71 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2925  hypothetical protein  29.15 
 
 		 3138 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.844856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  32.97 
 
 		 885 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.5 
 
 		 3168 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  29.27 
 
 		 894 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  34.34 
 
 		 974 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1406 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  35.83 
 
 		 963 aa  44.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.35 
 
 		 8871 aa  44.3  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>