72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1781 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  100 
 
 		 724 aa  1454    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.06 
 
 		 1931 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.39 
 
 		 1035 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30.82 
 
 		 777 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  28.18 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  29.55 
 
 		 461 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  27.95 
 
 		 698 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  31.27 
 
 		 1056 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  29.19 
 
 		 838 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  28.34 
 
 		 954 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.19 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  27.4 
 
 		 697 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  27.11 
 
 		 919 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.23 
 
 		 595 aa  88.2  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30 
 
 		 471 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  32.64 
 
 		 620 aa  87.8  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.76 
 
 		 635 aa  87.8  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  29.96 
 
 		 564 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.34 
 
 		 810 aa  84.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.66 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1001 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.41 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1121 aa  77.4  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  30.12 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.71 
 
 		 940 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  27.85 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  57.38 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  30.1 
 
 		 1092 aa  73.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 749 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.75 
 
 		 614 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  24.72 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  28.96 
 
 		 641 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  26.52 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  28.99 
 
 		 245 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  29.73 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1024 aa  63.9  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.16 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  31.34 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  40.51 
 
 		 297 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.88 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  37.93 
 
 		 679 aa  61.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  47.14 
 
 		 873 aa  60.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  43.66 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.31 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  25.2 
 
 		 805 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  43.55 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  46.38 
 
 		 1482 aa  57.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  22.66 
 
 		 820 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.02 
 
 		 1300 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  24.15 
 
 		 582 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  27.08 
 
 		 720 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  22.86 
 
 		 422 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  40.91 
 
 		 518 aa  52.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  42.86 
 
 		 717 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  23.17 
 
 		 892 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  40 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.1 
 
 		 341 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.29 
 
 		 1236 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.81 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.66 
 
 		 594 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  28.45 
 
 		 972 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 425 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  28.48 
 
 		 623 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1321 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.67 
 
 		 1189 aa  47.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 2082 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  26.5 
 
 		 446 aa  47  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 		 746 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1314 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  39.71 
 
 		 1814 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.7 
 
 		 505 aa  44.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.21 
 
 		 1969 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>