91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1007 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  83.38 
 
 		 698 aa  1189    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 697 aa  1438    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  46.31 
 
 		 561 aa  320  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  43.79 
 
 		 930 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  32.13 
 
 		 581 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44 
 
 		 1085 aa  230  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  33.95 
 
 		 709 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35.12 
 
 		 749 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  33.7 
 
 		 1035 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  45.96 
 
 		 433 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.55 
 
 		 1931 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.5 
 
 		 838 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  29.51 
 
 		 461 aa  124  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.73 
 
 		 810 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.32 
 
 		 777 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  62.34 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  27.19 
 
 		 1056 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  61.33 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  27.22 
 
 		 724 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  68.25 
 
 		 958 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.22 
 
 		 735 aa  97.4  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  53.33 
 
 		 488 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  63.38 
 
 		 361 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  53.57 
 
 		 668 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  63.01 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  58.33 
 
 		 294 aa  94.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  58.57 
 
 		 676 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  61.11 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  60.27 
 
 		 848 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  59.46 
 
 		 479 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  57.14 
 
 		 298 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  45.1 
 
 		 869 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  54.32 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  48.84 
 
 		 390 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  52.44 
 
 		 389 aa  87.8  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.11 
 
 		 595 aa  87.4  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  53.52 
 
 		 831 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  55.56 
 
 		 930 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.22 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  26.73 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  60.32 
 
 		 522 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  52.56 
 
 		 919 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  28.09 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  52.86 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  51.39 
 
 		 110 aa  84  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  53.52 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  50 
 
 		 522 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  50 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.43 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.57 
 
 		 1092 aa  81.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  60.32 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  35.26 
 
 		 564 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.24 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  52.86 
 
 		 735 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.41 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  28.29 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  43.12 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.21 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  32.5 
 
 		 638 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  48.61 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.77 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.51 
 
 		 940 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  45.88 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  45.71 
 
 		 960 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1121 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.34 
 
 		 871 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  29.61 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  26.49 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  25.25 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.48 
 
 		 614 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.44 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  27.37 
 
 		 954 aa  64.3  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.98 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  46.03 
 
 		 887 aa  62  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  49.21 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  40.66 
 
 		 883 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  30.64 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  37.7 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0577  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.67 
 
 		 262 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  23.92 
 
 		 831 aa  51.6  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  30 
 
 		 424 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.06 
 
 		 379 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  25.89 
 
 		 304 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.29 
 
 		 1531 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  24.48 
 
 		 272 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.81 
 
 		 1332 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  25.22 
 
 		 899 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  25.68 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  25.29 
 
 		 1309 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  32 
 
 		 427 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>