39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1336 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  100 
 
 
272 aa  567  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  69.81 
 
 
268 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  60.61 
 
 
271 aa  350  1e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  60.61 
 
 
271 aa  350  2e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  49.25 
 
 
255 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  48.5 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  33.22 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  36.07 
 
 
303 aa  125  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  32.52 
 
 
307 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  33.22 
 
 
323 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  33.68 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  31.47 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  29.26 
 
 
395 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  29.55 
 
 
477 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  29.69 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  28.95 
 
 
592 aa  84  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  27.03 
 
 
934 aa  80.1  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  28.73 
 
 
688 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  28.52 
 
 
640 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.92 
 
 
789 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  26.96 
 
 
688 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  25.82 
 
 
820 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.51 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.54 
 
 
535 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  25.09 
 
 
814 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  25.86 
 
 
364 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  25.99 
 
 
652 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  25.99 
 
 
652 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  24.92 
 
 
753 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25.91 
 
 
494 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  35.71 
 
 
354 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  24.62 
 
 
364 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  24.35 
 
 
697 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  21.07 
 
 
599 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  35.19 
 
 
571 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  25 
 
 
405 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  42.22 
 
 
487 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  28.24 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  25.12 
 
 
812 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>