140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1684 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  100 
 
 		 871 aa  1697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.31 
 
 		 641 aa  195  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  38.04 
 
 		 635 aa  188  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.13 
 
 		 1931 aa  179  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.04 
 
 		 940 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  37.31 
 
 		 471 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  30.92 
 
 		 638 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  39.59 
 
 		 570 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  33.43 
 
 		 375 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.99 
 
 		 810 aa  148  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.54 
 
 		 735 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  28.82 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  34.63 
 
 		 505 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  35.18 
 
 		 341 aa  127  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  34.38 
 
 		 1200 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  37.76 
 
 		 352 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  32.13 
 
 		 1092 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  38.74 
 
 		 1001 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 831 aa  109  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  30.27 
 
 		 547 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1121 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.48 
 
 		 777 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.95 
 
 		 892 aa  102  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.28 
 
 		 820 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  32.08 
 
 		 409 aa  95.9  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.95 
 
 		 458 aa  94.4  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  41.36 
 
 		 302 aa  94  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  30 
 
 		 500 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  36.04 
 
 		 1035 aa  91.3  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  41.35 
 
 		 954 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  31.71 
 
 		 297 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.73 
 
 		 677 aa  87.8  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.46 
 
 		 960 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  31.68 
 
 		 838 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  38.79 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  35.12 
 
 		 1056 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.43 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  37.57 
 
 		 360 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  37.1 
 
 		 433 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  29.19 
 
 		 724 aa  80.9  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  27.49 
 
 		 899 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  30.25 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  36.55 
 
 		 153 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.12 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  42.11 
 
 		 919 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  32.72 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  32.96 
 
 		 697 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.72 
 
 		 709 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  28.25 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  28.75 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  32.78 
 
 		 698 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.82 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  26.98 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.73 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.73 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.73 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.18 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.27 
 
 		 685 aa  67  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.42 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  25.22 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  24.69 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  31.14 
 
 		 707 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.65 
 
 		 1628 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  22.28 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.81 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  25.21 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  25.22 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  30.8 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.69 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  30.6 
 
 		 308 aa  62  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.64 
 
 		 1242 aa  61.6  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  27.39 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  23.86 
 
 		 423 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  30.92 
 
 		 749 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  36.51 
 
 		 525 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25.21 
 
 		 863 aa  60.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.33 
 
 		 594 aa  60.1  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  32.88 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.75 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23.9 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23.9 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.16 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  26.75 
 
 		 1025 aa  57.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  22.15 
 
 		 459 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  24.07 
 
 		 404 aa  56.6  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30.98 
 
 		 620 aa  56.2  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  23.28 
 
 		 439 aa  56.2  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.07 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  21.31 
 
 		 462 aa  55.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.45 
 
 		 467 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  23.13 
 
 		 439 aa  55.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.97 
 
 		 445 aa  55.5  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.58 
 
 		 2272 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  24.65 
 
 		 483 aa  55.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>