More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3630 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  100 
 
 		 500 aa  1004    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  58.7 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  56.46 
 
 		 162 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  56.3 
 
 		 173 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  53.85 
 
 		 205 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  51.7 
 
 		 173 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  31.9 
 
 		 638 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  37.55 
 
 		 570 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.33 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  38.49 
 
 		 352 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  46.4 
 
 		 165 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  45 
 
 		 193 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  36.15 
 
 		 302 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  28.19 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  29.94 
 
 		 409 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.59 
 
 		 735 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30.77 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1001 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  35.25 
 
 		 871 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  33.45 
 
 		 1200 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.23 
 
 		 960 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  25.99 
 
 		 501 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.65 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  33.47 
 
 		 641 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.01 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.01 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.47 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.62 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  32.02 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.79 
 
 		 810 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  23.66 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  33.09 
 
 		 153 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.9 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.45 
 
 		 685 aa  70.5  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.86 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  24.31 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  27.17 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  23.75 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  25.77 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  26.93 
 
 		 899 aa  67.8  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  35.12 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.45 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.43 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  29.81 
 
 		 1242 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  28.97 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.56 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.56 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.56 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  43.86 
 
 		 104 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  23.24 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  33.71 
 
 		 98 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  42.19 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.29 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  35.03 
 
 		 1628 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23.77 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  34.88 
 
 		 127 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  42.86 
 
 		 106 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  43.64 
 
 		 108 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  37.88 
 
 		 106 aa  61.2  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  32.53 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  44.64 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  35.94 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.65 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  46.3 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  37.18 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  35.21 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  37.5 
 
 		 98 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  38.18 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.05 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  29.13 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  20.88 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  22.79 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  22.79 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  40.35 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  40.62 
 
 		 106 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.35 
 
 		 108 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  29.63 
 
 		 108 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  36.23 
 
 		 107 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  31.76 
 
 		 274 aa  59.7  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  29.81 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  31.76 
 
 		 287 aa  59.3  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  37.1 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  45.45 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.6 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  24.06 
 
 		 259 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.78 
 
 		 109 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  36.92 
 
 		 106 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  29.28 
 
 		 671 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  45.45 
 
 		 108 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>