More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0633 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  41.29 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  44.78 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  53.85 
 
 		 500 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  46.62 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  40.65 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2110  thioredoxin  38.83 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000269278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  41.67 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  38.46 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  36.67 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  39.24 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  38.89 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  41.67 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  33.86 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  39.13 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  34.86 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  34.44 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  40.28 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  31.9 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  40.96 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  40.91 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.55 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  39.53 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  38.95 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  41.94 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32.38 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  34.83 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  41.94 
 
 		 108 aa  62  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  38.64 
 
 		 109 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  35.23 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  34.44 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  40.24 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  43.86 
 
 		 102 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  42.19 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  37.84 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  29.23 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  35.23 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  38.37 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.55 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  39.53 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  37.35 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.78 
 
 		 110 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.5 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  33.33 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.55 
 
 		 104 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  38.37 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  35.14 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  39.56 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  40.26 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2157  thioredoxin  36.67 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  40.26 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  36.67 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  34.09 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.07 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.21 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  37.93 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  38.71 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  36.67 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  32.04 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  32.04 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  35.56 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  37.65 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  35.37 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.37 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  34.44 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  36.84 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  34.67 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  35.71 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.78 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  35.87 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  33.33 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  37.35 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  37.7 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.68 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  35.29 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  37.1 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  40 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  37.21 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  35.11 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  32.61 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  32.61 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  32.63 
 
 		 108 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.23 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2247  thioredoxin  35.56 
 
 		 113 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203984  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  33.78 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  32.79 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  33.78 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  35.48 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  33.78 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  36.78 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  33.78 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  35.56 
 
 		 110 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>