31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1716 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  40.35 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  35.88 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  45 
 
 		 500 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  34.57 
 
 		 165 aa  99  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  30.3 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  35.26 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  31.07 
 
 		 88 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  32.65 
 
 		 87 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  30.21 
 
 		 133 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  27.36 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  32.1 
 
 		 106 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  32.67 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  28.95 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  34.85 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  28.44 
 
 		 125 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  26.61 
 
 		 125 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  30.77 
 
 		 421 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  29 
 
 		 98 aa  43.9  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  36.14 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  28.21 
 
 		 105 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.1 
 
 		 355 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  31.11 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  24.76 
 
 		 98 aa  42  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  26.5 
 
 		 107 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  32.35 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  25 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  24.75 
 
 		 107 aa  41.2  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4260  thioredoxin  28.4 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  30.67 
 
 		 98 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>