More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1185 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  100 
 
 		 125 aa  259  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  54.4 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  56 
 
 		 125 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  54.31 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  55.2 
 
 		 125 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  47.15 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  47.83 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  57.3 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  55.79 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  53.49 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  55.81 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  53.41 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  44.33 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  47.62 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  35.48 
 
 		 179 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  31.93 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  39.77 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  39.02 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  38.46 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  38.3 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  35.92 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.26 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  36.05 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  41.18 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  37.5 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.76 
 
 		 918 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.76 
 
 		 301 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  39.76 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  43.75 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  36.26 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  43.04 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  39.76 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  36.47 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  34.07 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  38.1 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  38.2 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  38.75 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  41.67 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  38.78 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  36.14 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  36.14 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.95 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  31.96 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  39.56 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  37.65 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40.51 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.97 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.55 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  41.25 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  32.97 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  36.14 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  38.78 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  37.08 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  38.55 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  38.78 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.66 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.55 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  40.74 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  36.78 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  35.16 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.55 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  35 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  41.56 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.19 
 
 		 282 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  37.65 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  40.51 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  39.51 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.35 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.35 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.35 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.35 
 
 		 282 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  42.5 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  41.1 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  35.8 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  35.48 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  41.77 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  39.47 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  34.83 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  35 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  40.26 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  35.53 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  41.1 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  36.96 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  41.1 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  35 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>