More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4260 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4260  thioredoxin  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  36.47 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  33.66 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  30.1 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  30.69 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.35 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  30.39 
 
 		 259 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  36.36 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  36.36 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  34.04 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  36.36 
 
 		 170 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  36.36 
 
 		 170 aa  67  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  30.48 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  32.05 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0928  thioredoxin  33.98 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  39.29 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  39.68 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  34.34 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  39.68 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  37.08 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  34.34 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.41 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  34.88 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  34.65 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  37 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  37.08 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  31.31 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  35 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  30.91 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  36.36 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  36.36 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  33.98 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  34.12 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  35.35 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  30.1 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  36 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  32.99 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  37.14 
 
 		 272 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  31.82 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  36.26 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  32.08 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  35 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  29.81 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  28.57 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  27.78 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  30.3 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  29.59 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  29.03 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  35.9 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  39.73 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  38 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  38.16 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  34.74 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  30.48 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  31.96 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.29 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  32.99 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  32.5 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  30.69 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.32 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  30.91 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  32.94 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  30.34 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.9 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  35.35 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.32 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  35 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  39.02 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  36.51 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.32 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  32.22 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0504  thioredoxin  32.99 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  36.05 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  30 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  28.72 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  35 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  32.26 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  28.87 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  36.36 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>