More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2201 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  100 
 
 
109 aa  214  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  93.33 
 
 
110 aa  196  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  90.65 
 
 
110 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  56.7 
 
 
110 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  53.06 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  55.34 
 
 
150 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  48.57 
 
 
109 aa  121  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  48.08 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  48.08 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  50 
 
 
109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  52.48 
 
 
115 aa  116  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  47.12 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  44.23 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  46.15 
 
 
109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  48 
 
 
106 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  49.48 
 
 
107 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  45.1 
 
 
110 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  48.96 
 
 
109 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  47.92 
 
 
108 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  49.48 
 
 
107 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  43.56 
 
 
107 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  45.19 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  46.88 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  46.88 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  45.1 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  42.42 
 
 
110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  45.19 
 
 
107 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  41.9 
 
 
107 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  46.39 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  42.06 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  42.06 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  42.99 
 
 
107 aa  107  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.86 
 
 
107 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  48.48 
 
 
108 aa  107  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  42.99 
 
 
107 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  45.36 
 
 
106 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  46.88 
 
 
108 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  42.99 
 
 
124 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  45.1 
 
 
106 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.19 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  45.54 
 
 
106 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  41.18 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  46.39 
 
 
107 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  42.99 
 
 
107 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.99 
 
 
107 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  45.36 
 
 
119 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  42.99 
 
 
107 aa  105  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.19 
 
 
107 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.19 
 
 
107 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  38.61 
 
 
107 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.19 
 
 
107 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  44 
 
 
106 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  41.51 
 
 
125 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  42.06 
 
 
109 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  45.19 
 
 
113 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  40.78 
 
 
107 aa  104  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  42.57 
 
 
108 aa  104  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  47.42 
 
 
107 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  42 
 
 
107 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  42.42 
 
 
106 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  42.72 
 
 
106 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  41.58 
 
 
108 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  45.16 
 
 
110 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  47.42 
 
 
108 aa  104  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  39.81 
 
 
105 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  48.11 
 
 
110 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  41.12 
 
 
107 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  42.06 
 
 
108 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  43.69 
 
 
106 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  44.55 
 
 
106 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  45.36 
 
 
107 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  45.45 
 
 
109 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  42.72 
 
 
107 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  43.75 
 
 
103 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  44.33 
 
 
106 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0243  thioredoxin  43.56 
 
 
109 aa  102  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  41.41 
 
 
109 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  42.45 
 
 
110 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  43.56 
 
 
123 aa  102  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  42.86 
 
 
109 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3380  thioredoxin  49.48 
 
 
109 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000757275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>