More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4213 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  100 
 
 		 109 aa  219  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  71.57 
 
 		 106 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  66.36 
 
 		 108 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  59.81 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  58.88 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  59.81 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  63.11 
 
 		 108 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  57.94 
 
 		 124 aa  136  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  57.01 
 
 		 108 aa  135  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  57.94 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  52.34 
 
 		 107 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  53.27 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  55.14 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  57.01 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  128  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  54.21 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  56.25 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  55.77 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  56.07 
 
 		 107 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  55.14 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  57.55 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  55.88 
 
 		 108 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  55.34 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  57.43 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  50.47 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  53.4 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  52.88 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  53.27 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  54.29 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  58.06 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  49.06 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  50.94 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  51.46 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  48.04 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  53.77 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  50.96 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  51.43 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  117  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  53.77 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  52.38 
 
 		 104 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  46.15 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  54.84 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  52.04 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  52.34 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  50.49 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  50.47 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  46.15 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  46.15 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  50.96 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  50 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  56.25 
 
 		 106 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  56.25 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  48.98 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  57.29 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  52.48 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  52.69 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  52 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  45.71 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  52.34 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  49.49 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  48.57 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  49.5 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>