More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1362 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  222  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  45.1 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.2 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  42.42 
 
 		 107 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  42.42 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  42.42 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  38.83 
 
 		 223 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  37.14 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  39 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  37.14 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  40.2 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  40.95 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  41.18 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  44.44 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  36.27 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  42.53 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  42.55 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  37.25 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  36.54 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  37.25 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  43.9 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  39.8 
 
 		 106 aa  94.7  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  35.29 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  38 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  36.27 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  38.14 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  42.16 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  36.27 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  41.49 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  38 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  37.62 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  39.8 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  37 
 
 		 108 aa  93.2  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  40.2 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  40.23 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  39.58 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  37 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  35.29 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  36 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  45.78 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  34 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  38.1 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  42.86 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  40.2 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  38.24 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  41.18 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  38.24 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  36.63 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  39.18 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  39.18 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  40.2 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  36.63 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  38 
 
 		 259 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  38.83 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  38.54 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  34.62 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  36.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  42.22 
 
 		 108 aa  90.9  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  45.78 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  45.78 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  45.78 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  45.78 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  45.78 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>