More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6550 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6550  thioredoxin domain protein  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  47.96 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  47.52 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  47.96 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  48.51 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  44 
 
 		 110 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  43.3 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  42 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  46.53 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  44.55 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  44.05 
 
 		 223 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  40 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4213  thioredoxin  47.52 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  45.16 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  44.58 
 
 		 109 aa  84.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  45.26 
 
 		 108 aa  84.3  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0189  thioredoxin 1  40.91 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.345183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  48.39 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  40.4 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  45.65 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  45.16 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  37.62 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  42.57 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  40.38 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  36.73 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  42.16 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  43.56 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  44.68 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  40.59 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  35.92 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  39.39 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  42.39 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  39.22 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  39.39 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  40.59 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  39.39 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  43.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  42.71 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  39.6 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  35.92 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  41.58 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  49.35 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  39.8 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0118  thioredoxin  44.55 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  38.61 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  44.05 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  43.62 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  43.14 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  39.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  38.83 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  39.22 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  41.18 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  36.63 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  38.95 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  35.64 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  41.98 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  36.89 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  40.82 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  37.86 
 
 		 106 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  41.05 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  44.05 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  38 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3221  thioredoxin  43.88 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  41.58 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  36.73 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  38.54 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  44.66 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  40.59 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  33.65 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  41.3 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>