More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0239 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  100 
 
 		 159 aa  316  9e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  60.53 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  59.22 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  51.85 
 
 		 136 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  49.54 
 
 		 119 aa  117  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  47.17 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  47.17 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  47.12 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  41.04 
 
 		 138 aa  96.3  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  45.26 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  45.74 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  45.65 
 
 		 106 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  35.66 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  43.43 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  43.64 
 
 		 259 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  44.57 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  44.21 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.05 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  43.82 
 
 		 114 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  38.95 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  52.78 
 
 		 299 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  43.48 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  43.01 
 
 		 107 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  43.62 
 
 		 107 aa  87.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  42.42 
 
 		 109 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  38.83 
 
 		 112 aa  87  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  39.39 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  33.61 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  46.43 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  42.17 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  45.26 
 
 		 115 aa  86.3  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  46.91 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  48.86 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  43.14 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  42.11 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  42.11 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  44.21 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  42.55 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  40.86 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  39.6 
 
 		 269 aa  85.1  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  43.82 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  40.22 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  41.3 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.62 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  41.49 
 
 		 109 aa  84.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  42.39 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  42.39 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  40.62 
 
 		 238 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  41.05 
 
 		 105 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  40.62 
 
 		 107 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  39.77 
 
 		 110 aa  84  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  42.39 
 
 		 106 aa  84  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  44.44 
 
 		 102 aa  84  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  39.05 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  31.94 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.62 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  41.41 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  43.16 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.62 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.62 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.16 
 
 		 108 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.62 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  45.98 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3727  Thioredoxin domain  36.79 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  37.5 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  48.05 
 
 		 107 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  28.37 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  46.43 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  42.11 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  41.49 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  43.16 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.68 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  44.87 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  49.35 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  49.35 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  49.35 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  44.58 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  46.43 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  35.92 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  42.17 
 
 		 310 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  31.2 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  32.06 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  44.58 
 
 		 104 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  40.22 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.41 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.96 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  46.34 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.96 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  44.58 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  42.7 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  40.91 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  43.37 
 
 		 104 aa  80.1  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  39.58 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  40.21 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.37 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  40.96 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>