More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3729 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  49.65 
 
 
136 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  55.56 
 
 
120 aa  141  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  61.9 
 
 
159 aa  140  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  57.26 
 
 
119 aa  139  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  58.18 
 
 
113 aa  134  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  61.76 
 
 
119 aa  132  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  58.93 
 
 
119 aa  130  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  45.26 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  50 
 
 
102 aa  94.7  4e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  42.86 
 
 
114 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0097  thioredoxin  33.83 
 
 
149 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  49.38 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  39.42 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  35.46 
 
 
238 aa  89.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  39 
 
 
108 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  42.11 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  42.11 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  42.11 
 
 
109 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  39.29 
 
 
259 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  48.28 
 
 
110 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  37.37 
 
 
107 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  40 
 
 
110 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  40.86 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  30.5 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  37.5 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  43.9 
 
 
189 aa  85.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  37.37 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  40 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  43.96 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  44.71 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  44.05 
 
 
108 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  37.37 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  40.86 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  48.19 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  40.86 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  36.94 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  39.78 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0227  thioredoxin  32.87 
 
 
138 aa  84.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  84.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  45.78 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  43.01 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  40.95 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  38.04 
 
 
109 aa  84.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  41.57 
 
 
109 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  40.2 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  38.39 
 
 
257 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  43.33 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  39.13 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  40.86 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  39.13 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  83.6  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  45.65 
 
 
109 aa  83.6  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  42.39 
 
 
108 aa  83.6  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  41.3 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  45.68 
 
 
106 aa  83.6  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  44.05 
 
 
108 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  38.04 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  41.3 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  32.99 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  37.89 
 
 
107 aa  82.8  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  49.33 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.53 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  38.04 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  39.58 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  40.22 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  36.73 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  40.22 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  41.67 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  40.22 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  37.86 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  38.61 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  46.51 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  39.78 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0711  thioredoxin  31.08 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  38.61 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  37.63 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  41.84 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  36.63 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  39.13 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  39.33 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  37.76 
 
 
106 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1545  thioredoxin  38.71 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  39.02 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  38.71 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  39.13 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  40.22 
 
 
406 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  38.04 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  39.13 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  42.86 
 
 
302 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>