More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3617 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  100 
 
 		 173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  50 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  52.44 
 
 		 162 aa  167  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  41.26 
 
 		 205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  50.96 
 
 		 500 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  37.5 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  35.26 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  48.28 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  43.48 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  41.56 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  46.15 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  42.19 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  46.15 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  34.29 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  42.19 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.78 
 
 		 282 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  35 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  38.46 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  47.69 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  38.71 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  44.83 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.89 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  42.03 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  47.27 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.5 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  36.36 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  39.13 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  29 
 
 		 918 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  43.86 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  44.62 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  41.82 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  40.85 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  42.11 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  37.68 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  29 
 
 		 301 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  34.83 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  34.78 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  40 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  37.1 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  37.1 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  27.69 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  34.92 
 
 		 107 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2493  thioredoxin  30.77 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  40.58 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  43.64 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  39.68 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  34.78 
 
 		 282 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.21 
 
 		 285 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  34.92 
 
 		 235 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  42.19 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  43.64 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  40.62 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  34.62 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  40.85 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  34.12 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  41.07 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  40 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.82 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  41.07 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  41.54 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  33.64 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  31.58 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  34.18 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  45.45 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  41.82 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  36.11 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  28.57 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  43.48 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  33.68 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  35.48 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  42.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  42.19 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  29.7 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  35.06 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  28.77 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  40.68 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  41.38 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  41.82 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  38.33 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  37.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  32.86 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  44.44 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  36.84 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.46 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  38.96 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  47.27 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.46 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  32.86 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.5 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  33.33 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  35.94 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  40 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  43.64 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  41.82 
 
 		 107 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  34.94 
 
 		 107 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.29 
 
 		 285 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  38.1 
 
 		 274 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  29.89 
 
 		 282 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  37.21 
 
 		 297 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>