More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1016 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  39.22 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  45.12 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  45.12 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.95 
 
 
105 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  34.65 
 
 
108 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  34.31 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  43.9 
 
 
104 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  41.18 
 
 
103 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  41.58 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  39.39 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.59 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  38.3 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  40.59 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  36.27 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.59 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  35.64 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3651  thioredoxin  31.37 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  39.39 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  34.29 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  37.11 
 
 
257 aa  80.1  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35.29 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  32.67 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30.69 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  36.36 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  38.61 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  32.35 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  36.36 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  36.08 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3022  thioredoxin  39.56 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  32.67 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  30.69 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  36.17 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32.65 
 
 
259 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  31.37 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.69 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  34.69 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  34.65 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1196  thioredoxin  34.02 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  32.35 
 
 
109 aa  76.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.35 
 
 
109 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.33 
 
 
109 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  32.67 
 
 
107 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  37.62 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  34.31 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  32.35 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  31.07 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1546  thioredoxin  36.36 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.350487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  32.67 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  30.69 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  34.65 
 
 
105 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  38.54 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  32.04 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  34.65 
 
 
105 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  34.65 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  35.11 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  30.48 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  34.02 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  32.04 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  37.23 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.02 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  33.66 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  74.7  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  38.1 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  31.68 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  32.67 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  32.67 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  34.69 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  35.16 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  33 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  37.63 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  36.63 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  29.7 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0360  thioredoxin  34.34 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  36.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  36.63 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  32.35 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  33.67 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  31.07 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  28.71 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  29.41 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.41 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  36.27 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  32.99 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4084  thioredoxin  31.96 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>