More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2353 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2353  thioredoxin  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000260475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2283  thioredoxin  43.79 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000888091  normal  0.229948 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  39.87 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3617  thioredoxin  37.93 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  46.4 
 
 		 500 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0633  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  40.65 
 
 		 205 aa  103  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0261257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1716  hypothetical protein  34.57 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0680604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  48.48 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  35.29 
 
 		 918 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  41.43 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.25 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.25 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.25 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  31.73 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  36.71 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  39.06 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  34.51 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  36.25 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  39.19 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  39.06 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  48.39 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  36.76 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  35.94 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  35.44 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  36.47 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  41.27 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  37.33 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  43.64 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  40.62 
 
 		 109 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  49.09 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  28.57 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  42.47 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  29.75 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  30.85 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  49.09 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  39.44 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  43.75 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  36 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  43.86 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  37.88 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  41.94 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.89 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.89 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  46.43 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  34.18 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37950  thioredoxin  47.27 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  39.44 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  38.71 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  35.94 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  35.79 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  45.45 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  39.06 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  38.89 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  36 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  42.62 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  36.23 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  38.18 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  31.03 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  37.5 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  44.64 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  32.53 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0835  thioredoxin  35.62 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  32 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  44.64 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  36.62 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  30.3 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  27.2 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  27.54 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  30 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  37.88 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  41.67 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  30 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  35.9 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  35.44 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  38.03 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0946  thioredoxin  29.91 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  34.18 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  38.46 
 
 		 109 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  45.45 
 
 		 302 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  33.33 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  40 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  27.54 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  41.82 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  27.62 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  37.66 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  43.1 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  34.38 
 
 		 125 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  41.67 
 
 		 303 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1831  thioredoxin  45.45 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  34.18 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  26.72 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>