More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0517 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  83.2 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  71.2 
 
 		 125 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  68.6 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  67.59 
 
 		 130 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  58.97 
 
 		 127 aa  150  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  55.2 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  57.3 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  58.14 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  55.79 
 
 		 129 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  47.46 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  53.41 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  48.35 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  52.94 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  51.19 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  44.12 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  42.42 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  41.35 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.49 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  37.11 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  46.75 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  43.82 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  43.82 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  37.23 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  40.4 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  40.2 
 
 		 109 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  35.71 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  40 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  39.56 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  37.36 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  40.66 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  39 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  38.14 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  38 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  39.45 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  36.17 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  38.89 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  37.76 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  37.37 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  42.86 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  37.63 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.14 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  40.45 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  35.35 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  39.56 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  38.61 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  34.34 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  37.25 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  35.35 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  35.11 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  38 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  40 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0762  thioredoxin  38.71 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000561264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.41 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  33.67 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  39.36 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  38.64 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  39.02 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  37.78 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  36.96 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35.42 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  36.71 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  38.64 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  38.1 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  38.1 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  38.1 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  34.34 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  39.24 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  37.21 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  36.17 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  37.62 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  38 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  34.74 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>