More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3604 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 127 aa  257  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  56.8 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  65.62 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  66.67 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  43.59 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  49.46 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  50 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  50 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  47.42 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  47.25 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  50.57 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  49.43 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  53.57 
 
 		 130 aa  97.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  50 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  40.86 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  37.72 
 
 		 179 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  38.1 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  36.9 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  36.17 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  36.17 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  41.77 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  39.51 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  38.55 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  38.27 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  38.27 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  36.47 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  38.27 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  43.04 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  36.78 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.51 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  42.5 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  29.91 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  36.78 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2201  thioredoxin  34.52 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  32.46 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  39.78 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  29.91 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  40.54 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  36.14 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  34.94 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  35.63 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  35.8 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.69 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  33.33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  45.95 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  37.97 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  35.63 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  35.44 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  35.37 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  31.4 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  36.36 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  39.19 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  32.71 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  33.73 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  34.94 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  38.96 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  34.69 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  41.03 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  37.8 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  37.18 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  41.03 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  36.14 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  36.71 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  33.33 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  37.8 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  36.71 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  34.23 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  31.78 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>