More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0855 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  62.31 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  67.59 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  61.61 
 
 		 125 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  56.92 
 
 		 125 aa  153  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  60.58 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  56.18 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  55.06 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  56.82 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  44.96 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  44.53 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  52.33 
 
 		 87 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  47.83 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  43.97 
 
 		 179 aa  97.1  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4059  thioredoxin domain-containing protein  51.19 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.653805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  43.96 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  46.67 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  47.73 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  45.45 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  43.96 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  43.96 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  43.96 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1651  hypothetical protein  44.16 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000147979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  39.56 
 
 		 105 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1353  thioredoxin C-2  35.05 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.114748  normal  0.184208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  42.05 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  39.77 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  40.91 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  43.18 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  39.39 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  43.18 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  39.56 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  42.86 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  39.56 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  37.08 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  35.85 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  39.77 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  37.76 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  41.67 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  38.46 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  37.76 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  39.56 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  38.2 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  42.11 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  37.37 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  40.91 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  35.56 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1003  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  35.56 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  35.79 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  39.13 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  38.04 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  39.56 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  35.19 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  39.36 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  38.04 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  38.2 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  39.33 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  30.77 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  35.71 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  37.78 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1679  thioredoxin  36.47 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  35.56 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  37.37 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  38.89 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  37.78 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  33.71 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  39.56 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  35.51 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  41.77 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  32.69 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  35.56 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  39.33 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  39.33 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7155  thioredoxin  38.71 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  40.66 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  34.95 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  35.92 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4537  thioredoxin  35.35 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  42.05 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1675  thioredoxin  35.11 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  35.96 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  38.46 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  42.67 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  34.02 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  35.71 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1746  thioredoxin  34.04 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  42.5 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0520  thioredoxin  36.05 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.609436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  32.32 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  37.08 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  31.11 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  34.48 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  39.78 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>