More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1504 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  58.01 
 
 
196 aa  238  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  59.09 
 
 
192 aa  234  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  57.14 
 
 
188 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  57.14 
 
 
188 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  55.93 
 
 
182 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  51.69 
 
 
189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  44.86 
 
 
191 aa  190  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  42.52 
 
 
128 aa  121  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  30.85 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  31.69 
 
 
188 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  34.93 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  32.17 
 
 
153 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  34.93 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  28.57 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  31.47 
 
 
156 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  31.47 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  30.07 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  32.24 
 
 
355 aa  88.2  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  35.17 
 
 
185 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.08 
 
 
110 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  34.74 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  34.04 
 
 
107 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  34.04 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  34.04 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  30 
 
 
108 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  37.23 
 
 
109 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  34.04 
 
 
107 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  34.07 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  34.07 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  36.17 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  36.17 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.74 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  30 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  38.3 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  35.11 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  38.24 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  38.3 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.57 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  30.91 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  35.71 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  28.57 
 
 
146 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  31.37 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  32.61 
 
 
107 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  36.26 
 
 
112 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  31.58 
 
 
105 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  29.09 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  36.26 
 
 
112 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  31.58 
 
 
106 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  37.65 
 
 
125 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  28.18 
 
 
108 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  32.98 
 
 
113 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  31.19 
 
 
133 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  34.09 
 
 
106 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  34.31 
 
 
141 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  32.58 
 
 
105 aa  62  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  31.91 
 
 
105 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  30.21 
 
 
109 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  38.1 
 
 
103 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  30.61 
 
 
106 aa  61.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.35 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  35.29 
 
 
106 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  35.29 
 
 
106 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.56 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  31.52 
 
 
107 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  33.7 
 
 
123 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  35.35 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  32.98 
 
 
105 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  33.66 
 
 
109 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  33.68 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4710  thioredoxin  29.35 
 
 
105 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.015363  normal  0.0508397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  36.05 
 
 
107 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  31.52 
 
 
107 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  36.17 
 
 
108 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  31.52 
 
 
106 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  32.5 
 
 
125 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  33.68 
 
 
109 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  32.61 
 
 
107 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  32.61 
 
 
107 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.47 
 
 
110 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>