More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2289 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  64.86 
 
 
182 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  58.79 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  57.14 
 
 
193 aa  228  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  54.95 
 
 
192 aa  224  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  52.49 
 
 
189 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  50 
 
 
191 aa  192  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  45.67 
 
 
128 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  34.24 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  30.43 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  39.16 
 
 
355 aa  107  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  32.58 
 
 
191 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  36.36 
 
 
153 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  34.43 
 
 
185 aa  102  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  32.76 
 
 
182 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  36.3 
 
 
189 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  34.93 
 
 
189 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  32.52 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  33.75 
 
 
156 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  37.76 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.96 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  36.89 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.26 
 
 
110 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  35.92 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  34.07 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  32.98 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  32.98 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  34.38 
 
 
108 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  35.42 
 
 
106 aa  63.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  32.63 
 
 
108 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  32.98 
 
 
108 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.96 
 
 
277 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  34.38 
 
 
107 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  35.79 
 
 
150 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  31.11 
 
 
107 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  30.77 
 
 
169 aa  61.6  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  32.65 
 
 
105 aa  61.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  30.53 
 
 
108 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  33.67 
 
 
107 aa  61.6  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.82 
 
 
109 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  37.5 
 
 
103 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  32.98 
 
 
109 aa  61.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  32.22 
 
 
106 aa  61.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  32.56 
 
 
106 aa  61.2  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  30.85 
 
 
104 aa  60.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  30.85 
 
 
146 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  33.7 
 
 
102 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  34.83 
 
 
105 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  31.91 
 
 
108 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  32.98 
 
 
111 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  30.93 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  31.11 
 
 
110 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  34.83 
 
 
282 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  30.85 
 
 
146 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  30.23 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  29.73 
 
 
107 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  35.05 
 
 
109 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37354  predicted protein  34.94 
 
 
131 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0644454  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  35.56 
 
 
110 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  34.07 
 
 
109 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5098  thioredoxin  39.29 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.590945  hitchhiker  0.000000265159 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  33.72 
 
 
107 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  34.02 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  35 
 
 
111 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5761  thioredoxin  34.04 
 
 
111 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626635  normal  0.389703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  29.59 
 
 
106 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  32.97 
 
 
108 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  33.68 
 
 
106 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  35.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  34.78 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  34.94 
 
 
109 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  35.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  35.63 
 
 
108 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  58.9  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>