More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2128 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  100 
 
 		 191 aa  386  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  50.55 
 
 		 196 aa  200  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  45.3 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  47.89 
 
 		 189 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  51.14 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  50 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  50 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  48.02 
 
 		 182 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  36.9 
 
 		 188 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  42.52 
 
 		 128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  34.09 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  36.36 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  40.69 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  31.03 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  34.51 
 
 		 153 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  33.1 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  31.79 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  32.24 
 
 		 189 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  32.39 
 
 		 156 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  32.11 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  32.08 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  31.13 
 
 		 107 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  34.41 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  34.41 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  34.41 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  30.43 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  34.83 
 
 		 108 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  32.58 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  35.71 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  33.33 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  32.43 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  30.19 
 
 		 107 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  31.18 
 
 		 108 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  35.96 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  31.18 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3579  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.248424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  33.33 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  26.8 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28.26 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  34.07 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  33.7 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  32.97 
 
 		 918 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  28.79 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  33.7 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  35.96 
 
 		 108 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  30.77 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  31.33 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  30.3 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  31.46 
 
 		 107 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  29.25 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  32.97 
 
 		 301 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  27.08 
 
 		 106 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  31.82 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  30.93 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  29.35 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  28.42 
 
 		 105 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  31.82 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  30.53 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  28.09 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  31.03 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  29.35 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30.34 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  29.35 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  31.52 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  31.4 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  33.71 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  25.69 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.97 
 
 		 600 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  29.89 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  29.91 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4854  thioredoxin  27 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  32.65 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  28.42 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  32.26 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  28.3 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 316 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>