More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0274 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
191 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  66.84 
 
 
185 aa  244  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  59.16 
 
 
188 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  46.7 
 
 
188 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  44.51 
 
 
189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  42.93 
 
 
189 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  32.64 
 
 
182 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  31.25 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  33.85 
 
 
189 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  34.55 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  30.94 
 
 
192 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  34.74 
 
 
196 aa  111  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  32.02 
 
 
182 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  28.24 
 
 
156 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  34.38 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  34.38 
 
 
188 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  36.57 
 
 
191 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  39.2 
 
 
128 aa  99  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  36.36 
 
 
355 aa  71.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  41.18 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  36.73 
 
 
104 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  39.53 
 
 
102 aa  62.4  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.56 
 
 
611 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  39.53 
 
 
102 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  28.79 
 
 
368 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  38.46 
 
 
105 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  41.77 
 
 
113 aa  60.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10646  predicted protein  33.33 
 
 
106 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0557348  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  34.44 
 
 
611 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  33.71 
 
 
617 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  36.71 
 
 
106 aa  60.5  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  37.8 
 
 
108 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  32.58 
 
 
615 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.22 
 
 
627 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  32.98 
 
 
104 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  36.05 
 
 
102 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  39.74 
 
 
101 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  36 
 
 
109 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.18 
 
 
627 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  32.95 
 
 
107 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  31.46 
 
 
615 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  31.46 
 
 
615 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.96 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  25.41 
 
 
133 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  37.21 
 
 
110 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.97 
 
 
810 aa  55.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  32.5 
 
 
608 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  34.12 
 
 
107 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  32.22 
 
 
165 aa  55.5  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  29.29 
 
 
138 aa  55.1  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.58 
 
 
108 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  34.26 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0275  thioredoxin family protein  30.43 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  25.66 
 
 
623 aa  55.1  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  38.2 
 
 
648 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  33.71 
 
 
105 aa  54.7  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  29.9 
 
 
110 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  33.67 
 
 
108 aa  54.7  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  30.93 
 
 
108 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  30.93 
 
 
110 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  30.93 
 
 
110 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  34.12 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  36.59 
 
 
109 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  35.48 
 
 
105 aa  53.9  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  34.57 
 
 
106 aa  54.3  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  38.1 
 
 
639 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26950  thioredoxin  33.73 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.766392  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.61 
 
 
752 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  24.67 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  34.83 
 
 
604 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  33.33 
 
 
105 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  31.46 
 
 
146 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  32.97 
 
 
106 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  31.11 
 
 
106 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.23 
 
 
624 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  34.15 
 
 
109 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  32.63 
 
 
102 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  35 
 
 
105 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  31.46 
 
 
146 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  30 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  28.42 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  30 
 
 
106 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>