More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02751 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
182 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  64.09 
 
 
181 aa  230  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  66.88 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  66.01 
 
 
153 aa  211  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  32.64 
 
 
191 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  35.21 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  36.65 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  37.37 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  38.52 
 
 
188 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  38.52 
 
 
188 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  34.03 
 
 
196 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  31.03 
 
 
191 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  35.56 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  31.22 
 
 
189 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  34.48 
 
 
189 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  32.93 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  34.91 
 
 
189 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  45.68 
 
 
128 aa  88.2  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
193 aa  88.2  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  35.79 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  36.26 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  31.58 
 
 
107 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  36.26 
 
 
108 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  39.77 
 
 
108 aa  59.3  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  32.98 
 
 
107 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  30.19 
 
 
109 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  35.16 
 
 
108 aa  58.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  37.5 
 
 
108 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.03 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  32.18 
 
 
108 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  36.36 
 
 
108 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  31.03 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  28.33 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  31.03 
 
 
290 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.03 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  28.33 
 
 
272 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  34.52 
 
 
108 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.56 
 
 
290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  27.52 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  33.72 
 
 
108 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  27.36 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  36.23 
 
 
102 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  30.68 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  32.97 
 
 
108 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  26.17 
 
 
133 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  36.36 
 
 
108 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  35.9 
 
 
104 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  31.11 
 
 
108 aa  55.8  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  36.36 
 
 
108 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.94 
 
 
108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.94 
 
 
108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  31.82 
 
 
108 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  26.17 
 
 
110 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  35.23 
 
 
108 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29 
 
 
406 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.94 
 
 
108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  35.16 
 
 
108 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  26.04 
 
 
259 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  36.76 
 
 
101 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  29.81 
 
 
108 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  30.68 
 
 
107 aa  54.7  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  33.33 
 
 
107 aa  55.1  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  31.82 
 
 
108 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  31.03 
 
 
108 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  32.63 
 
 
116 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  31.4 
 
 
108 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  25.2 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  34.44 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  28.12 
 
 
110 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  26.67 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  31.87 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  26.6 
 
 
257 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  36.76 
 
 
108 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  29.89 
 
 
289 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.89 
 
 
289 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  30.23 
 
 
108 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  29.13 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  32.18 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.89 
 
 
289 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  28.12 
 
 
105 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  20.78 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  32.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>