More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0244 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  75.82 
 
 		 153 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  75 
 
 		 156 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  64.09 
 
 		 182 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  34.09 
 
 		 191 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  37.65 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  36.52 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  33.92 
 
 		 196 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  33.81 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  32.98 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  46.46 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  35.95 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  32.07 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  32.7 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  32.7 
 
 		 188 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  31.93 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  30.43 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  41.67 
 
 		 128 aa  94.4  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  32.12 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  31.96 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  35.29 
 
 		 108 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  35.56 
 
 		 102 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  29 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4860  thioredoxin  32.98 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110096  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  30.11 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  34.12 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  31.4 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  32.98 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  34.72 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  35.44 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  32.98 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  27.45 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  32.98 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  30.93 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  32.22 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  34.09 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  28.87 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  26.6 
 
 		 257 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  29.9 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  29.9 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1854  thioredoxin  37.84 
 
 		 102 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  34.18 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  28.74 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  36.14 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  34.18 
 
 		 108 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  29.09 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30.23 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30.23 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30.23 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  30.53 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.41 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  28.87 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  26.8 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30.23 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  28.87 
 
 		 109 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4688  thioredoxin  29.03 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.376387  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  34.12 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  32.91 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  28.89 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  29.79 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  37.84 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  30.69 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1719  thioredoxin  37.84 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00129431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  32.95 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1262  Thioredoxin domain  29.46 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000573175  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  29.11 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  32.53 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  32.95 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  30.93 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.07 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  32.91 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  30.3 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  32.26 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  32.91 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  39.19 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.07 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  32.91 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  30.93 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  31.65 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  29.11 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  30.11 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  32.26 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>