More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03201 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  100 
 
 
189 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  93.12 
 
 
189 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  46.28 
 
 
188 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  42.93 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2070  thioredoxin-like protein TxlA  43.62 
 
 
185 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  46.63 
 
 
188 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  32.97 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02751  thioredoxin-like protein TxlA  33.68 
 
 
182 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3611  thioredoxin domain-containing protein  34.05 
 
 
196 aa  108  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1504  thioredoxin domain-containing protein  32.62 
 
 
193 aa  105  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.519816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3340  Thioredoxin domain protein  34.68 
 
 
182 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0244  thioredoxin-like protein TxlA  46.3 
 
 
181 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  37.27 
 
 
153 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8114  predicted protein  41.13 
 
 
128 aa  102  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2340  thioredoxin domain protein  35.44 
 
 
188 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2289  Thioredoxin domain protein  35.44 
 
 
188 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02641  thioredoxin-like protein TxlA  45.92 
 
 
156 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1263  Thioredoxin domain protein  28.72 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2128  thioredoxin  28.11 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587927  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45450  predicted protein  37.66 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 
604 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.37 
 
 
595 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.37 
 
 
595 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.37 
 
 
595 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  30.83 
 
 
109 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.14 
 
 
611 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  28.57 
 
 
133 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 
613 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 
613 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 
613 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
619 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.18 
 
 
610 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.05 
 
 
619 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  28.57 
 
 
110 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00075  protein disulfide-isomerase (Eurofung)  31.67 
 
 
368 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
619 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  36.36 
 
 
105 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
567 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0861  Thioredoxin domain  32.65 
 
 
104 aa  57  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.77 
 
 
628 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.63 
 
 
624 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
567 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  30 
 
 
609 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  27.62 
 
 
110 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 
619 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  27.62 
 
 
110 aa  55.5  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.25 
 
 
606 aa  55.1  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.77 
 
 
600 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  23.68 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  28.89 
 
 
113 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  26.67 
 
 
110 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  29.63 
 
 
106 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.29 
 
 
567 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.29 
 
 
567 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  34.18 
 
 
608 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  36.84 
 
 
604 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  33.33 
 
 
106 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  35.8 
 
 
471 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  29.76 
 
 
107 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.94 
 
 
603 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.29 
 
 
567 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.29 
 
 
466 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  25.64 
 
 
109 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  30.95 
 
 
110 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 
592 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.4 
 
 
602 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  27.88 
 
 
108 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  31.31 
 
 
731 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  29.13 
 
 
108 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0626  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 
471 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.72 
 
 
590 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.15 
 
 
752 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0617  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.84 
 
 
471 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0233  thioredoxin 1  33.72 
 
 
105 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.362513  normal  0.185715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  28.45 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  29.52 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  26.92 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  28.85 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  33.33 
 
 
106 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  28.85 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.72 
 
 
590 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  29.89 
 
 
107 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  28.85 
 
 
108 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  29.81 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0694  thioredoxin  32.29 
 
 
106 aa  52.4  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  27 
 
 
104 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.72 
 
 
590 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  30.23 
 
 
108 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
565 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  31.33 
 
 
109 aa  52.4  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  29.81 
 
 
108 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  28.26 
 
 
654 aa  52  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>