More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1181 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  100 
 
 		 628 aa  1269    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.72 
 
 		 789 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  44.82 
 
 		 750 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.22 
 
 		 586 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  44.09 
 
 		 731 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.27 
 
 		 810 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.7 
 
 		 626 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  38.25 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  40.44 
 
 		 629 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  37.74 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.29 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.1 
 
 		 624 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  41.06 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  41.55 
 
 		 623 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  40.03 
 
 		 630 aa  415  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.93 
 
 		 616 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.93 
 
 		 616 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.17 
 
 		 610 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.1 
 
 		 607 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  40.68 
 
 		 745 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.5 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.02 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.8 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.39 
 
 		 642 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.35 
 
 		 611 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.38 
 
 		 613 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  38.64 
 
 		 649 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  40.97 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.79 
 
 		 609 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.54 
 
 		 589 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  38.35 
 
 		 622 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.79 
 
 		 613 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.24 
 
 		 752 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.42 
 
 		 613 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  39.54 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.02 
 
 		 590 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  39.07 
 
 		 610 aa  386  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.93 
 
 		 590 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.28 
 
 		 591 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.3 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  37.73 
 
 		 603 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.09 
 
 		 606 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.86 
 
 		 604 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.95 
 
 		 624 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.3 
 
 		 619 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  35.65 
 
 		 626 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.43 
 
 		 654 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  37.08 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  37.08 
 
 		 615 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.3 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.12 
 
 		 590 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.85 
 
 		 604 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  41.93 
 
 		 639 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.83 
 
 		 619 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.93 
 
 		 591 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.93 
 
 		 628 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  38.16 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.86 
 
 		 606 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  36.68 
 
 		 617 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.31 
 
 		 624 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  37.67 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  39.38 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  36.54 
 
 		 615 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  38.07 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  36.59 
 
 		 631 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  39.74 
 
 		 604 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  36.82 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.3 
 
 		 616 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.4 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.66 
 
 		 595 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.35 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.29 
 
 		 611 aa  365  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  35.31 
 
 		 611 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.36 
 
 		 611 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.42 
 
 		 592 aa  359  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  37.66 
 
 		 614 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.71 
 
 		 635 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  38.59 
 
 		 627 aa  355  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.86 
 
 		 612 aa  355  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.12 
 
 		 585 aa  353  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  35.9 
 
 		 589 aa  353  8e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.29 
 
 		 600 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.68 
 
 		 631 aa  350  4e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  36.06 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.75 
 
 		 627 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.14 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  36.29 
 
 		 575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.78 
 
 		 614 aa  343  5e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.98 
 
 		 567 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  38.17 
 
 		 627 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  34.97 
 
 		 603 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  35.8 
 
 		 627 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  35.8 
 
 		 627 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.8 
 
 		 627 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.8 
 
 		 627 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.98 
 
 		 567 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 567 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.63 
 
 		 627 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.4 
 
 		 565 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.23 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>