More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4360 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 		 603 aa  1168    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  86.3 
 
 		 602 aa  999    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  82.09 
 
 		 600 aa  924    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  53.55 
 
 		 591 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  52.17 
 
 		 596 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  51.56 
 
 		 581 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  44.37 
 
 		 616 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.57 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  49.49 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.95 
 
 		 810 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  42.35 
 
 		 623 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.4 
 
 		 789 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  38.91 
 
 		 630 aa  379  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.78 
 
 		 589 aa  373  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.28 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.28 
 
 		 626 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.24 
 
 		 613 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  34.83 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.37 
 
 		 586 aa  363  3e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  36.72 
 
 		 731 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.89 
 
 		 563 aa  360  4e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  39.2 
 
 		 622 aa  360  5e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.51 
 
 		 642 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  38.47 
 
 		 750 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  35.65 
 
 		 575 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  38.63 
 
 		 625 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.06 
 
 		 624 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.97 
 
 		 654 aa  349  7e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  39.65 
 
 		 604 aa  349  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.14 
 
 		 752 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  39.29 
 
 		 745 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  38.49 
 
 		 626 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.69 
 
 		 612 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.31 
 
 		 616 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.31 
 
 		 616 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.3 
 
 		 583 aa  339  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  39.12 
 
 		 629 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  34.78 
 
 		 570 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  37.67 
 
 		 654 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  39.57 
 
 		 623 aa  335  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.38 
 
 		 603 aa  334  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.6 
 
 		 583 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  36.49 
 
 		 589 aa  332  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.66 
 
 		 624 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.68 
 
 		 590 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.31 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.31 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.31 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  33.22 
 
 		 577 aa  330  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.93 
 
 		 567 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.45 
 
 		 590 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.76 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.93 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.76 
 
 		 567 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.6 
 
 		 567 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.97 
 
 		 628 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 624 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  36.13 
 
 		 631 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  34 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.41 
 
 		 565 aa  324  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  37.18 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  40.25 
 
 		 577 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  36.26 
 
 		 649 aa  323  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.79 
 
 		 619 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.16 
 
 		 619 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.09 
 
 		 565 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  35.09 
 
 		 565 aa  323  7e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.24 
 
 		 609 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  36.48 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  36.48 
 
 		 615 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  35.25 
 
 		 565 aa  322  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.09 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  37.54 
 
 		 617 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.09 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.93 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.47 
 
 		 612 aa  321  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.45 
 
 		 590 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.76 
 
 		 565 aa  320  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.12 
 
 		 602 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.47 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.81 
 
 		 604 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.69 
 
 		 619 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.76 
 
 		 565 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.2 
 
 		 563 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  36.32 
 
 		 615 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.16 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.3 
 
 		 592 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  36.36 
 
 		 611 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  36.19 
 
 		 618 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.6 
 
 		 613 aa  316  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.29 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.78 
 
 		 611 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.6 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.66 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.72 
 
 		 600 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.51 
 
 		 611 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.29 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  45.05 
 
 		 605 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.82 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  36.56 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>