More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2274 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  71.77 
 
 		 603 aa  875    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  100 
 
 		 600 aa  1210    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  70.85 
 
 		 592 aa  838    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  59.49 
 
 		 624 aa  728    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.91 
 
 		 583 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.92 
 
 		 595 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.83 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  52.75 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.75 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.93 
 
 		 565 aa  571  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  52.83 
 
 		 565 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.22 
 
 		 595 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.22 
 
 		 595 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.16 
 
 		 583 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.93 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.93 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  52.47 
 
 		 565 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.11 
 
 		 565 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.29 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.29 
 
 		 567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.29 
 
 		 567 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.11 
 
 		 567 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.11 
 
 		 567 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.11 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  53.7 
 
 		 561 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  50.35 
 
 		 570 aa  532  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.37 
 
 		 610 aa  528  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.65 
 
 		 611 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  49.49 
 
 		 572 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.19 
 
 		 610 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.29 
 
 		 604 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.25 
 
 		 609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.12 
 
 		 619 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.29 
 
 		 619 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.83 
 
 		 613 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.85 
 
 		 613 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.32 
 
 		 613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.79 
 
 		 619 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.68 
 
 		 628 aa  514  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.32 
 
 		 602 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.29 
 
 		 619 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.35 
 
 		 624 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  46.55 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.92 
 
 		 592 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.11 
 
 		 608 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.99 
 
 		 631 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  48.4 
 
 		 570 aa  459  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.95 
 
 		 789 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  37.8 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.14 
 
 		 810 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  39.9 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  37.32 
 
 		 750 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.21 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  38.39 
 
 		 649 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.14 
 
 		 624 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  37.1 
 
 		 625 aa  360  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  36.56 
 
 		 622 aa  354  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  39.56 
 
 		 745 aa  353  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.11 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  37.76 
 
 		 630 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  37.89 
 
 		 639 aa  346  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  39 
 
 		 577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  36.92 
 
 		 632 aa  343  7e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.71 
 
 		 626 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  37.29 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.8 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  36.86 
 
 		 608 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.97 
 
 		 616 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.97 
 
 		 616 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  38.41 
 
 		 604 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.03 
 
 		 624 aa  332  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  36.77 
 
 		 605 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  35.28 
 
 		 610 aa  330  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  36.72 
 
 		 642 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  34.63 
 
 		 654 aa  329  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.82 
 
 		 612 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.9 
 
 		 752 aa  327  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.73 
 
 		 586 aa  324  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  35.56 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.97 
 
 		 628 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  36.15 
 
 		 623 aa  323  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  34.35 
 
 		 623 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  35.38 
 
 		 577 aa  319  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  39.75 
 
 		 570 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.12 
 
 		 590 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  33.5 
 
 		 618 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.38 
 
 		 590 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.49 
 
 		 602 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.23 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.67 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  34.88 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  34.32 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.66 
 
 		 654 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.86 
 
 		 570 aa  306  7e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.75 
 
 		 582 aa  306  9.000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  34.53 
 
 		 575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.84 
 
 		 612 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  37.9 
 
 		 571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.83 
 
 		 616 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.23 
 
 		 611 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>