More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4235 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 571 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  92.64 
 
 		 570 aa  941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  63.26 
 
 		 577 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  98.77 
 
 		 571 aa  1100    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  96.32 
 
 		 571 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  66.16 
 
 		 589 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  66.85 
 
 		 589 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  51.47 
 
 		 589 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44 
 
 		 612 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  43.94 
 
 		 654 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.77 
 
 		 612 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.99 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.48 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  39.72 
 
 		 750 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.96 
 
 		 590 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.05 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  44.35 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.52 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.89 
 
 		 590 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.9 
 
 		 624 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.05 
 
 		 628 aa  362  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.06 
 
 		 631 aa  360  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.86 
 
 		 810 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  39.66 
 
 		 629 aa  359  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.53 
 
 		 586 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  36.18 
 
 		 731 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.05 
 
 		 602 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.07 
 
 		 565 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.07 
 
 		 565 aa  356  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 567 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  41.64 
 
 		 745 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.9 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.5 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.07 
 
 		 565 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.9 
 
 		 604 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.34 
 
 		 613 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  39.07 
 
 		 565 aa  355  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.9 
 
 		 565 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.68 
 
 		 593 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 567 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.51 
 
 		 561 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.27 
 
 		 563 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.91 
 
 		 610 aa  352  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.03 
 
 		 606 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  36.35 
 
 		 630 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.84 
 
 		 586 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.7 
 
 		 619 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.99 
 
 		 565 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  38.99 
 
 		 565 aa  350  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.21 
 
 		 616 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.21 
 
 		 616 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  42.52 
 
 		 623 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.74 
 
 		 624 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.95 
 
 		 604 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  36.84 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.7 
 
 		 619 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.87 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.73 
 
 		 613 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.76 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.85 
 
 		 610 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.59 
 
 		 616 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.86 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.54 
 
 		 592 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.66 
 
 		 611 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.68 
 
 		 565 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.82 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.27 
 
 		 642 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.86 
 
 		 619 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  38.5 
 
 		 622 aa  343  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.7 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  37.9 
 
 		 603 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  39.13 
 
 		 626 aa  342  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.85 
 
 		 591 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.08 
 
 		 583 aa  339  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  41.55 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.21 
 
 		 572 aa  337  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.42 
 
 		 570 aa  336  7e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.96 
 
 		 592 aa  334  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  41.87 
 
 		 608 aa  334  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.81 
 
 		 591 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.43 
 
 		 595 aa  333  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  38.86 
 
 		 649 aa  333  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.73 
 
 		 628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.92 
 
 		 609 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.43 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  35.06 
 
 		 577 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.46 
 
 		 613 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.02 
 
 		 605 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  41.23 
 
 		 604 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.06 
 
 		 624 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  37.85 
 
 		 631 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.9 
 
 		 752 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  40.21 
 
 		 603 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.78 
 
 		 606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.11 
 
 		 611 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>