More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3801 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4235  protein-disulfide reductase  96.32 
 
 		 571 aa  923    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.892987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  92.12 
 
 		 570 aa  938    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3801  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 571 aa  1112    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  62.15 
 
 		 577 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1629  protein-disulfide reductase  96.85 
 
 		 571 aa  911    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  66.13 
 
 		 589 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  66.13 
 
 		 589 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  51.3 
 
 		 589 aa  505  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.39 
 
 		 612 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  44.1 
 
 		 654 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  45.8 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.67 
 
 		 789 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  39.9 
 
 		 750 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  45.15 
 
 		 590 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.08 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.82 
 
 		 635 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.89 
 
 		 590 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  43.69 
 
 		 590 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.05 
 
 		 810 aa  365  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.23 
 
 		 631 aa  362  8e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  40.03 
 
 		 629 aa  362  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.37 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.22 
 
 		 628 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.82 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.67 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.9 
 
 		 624 aa  356  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  35.73 
 
 		 731 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.33 
 
 		 585 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.71 
 
 		 613 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.92 
 
 		 624 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.61 
 
 		 610 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.91 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.53 
 
 		 593 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.56 
 
 		 606 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  41.51 
 
 		 745 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  36.91 
 
 		 586 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.53 
 
 		 567 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.44 
 
 		 604 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.53 
 
 		 567 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.53 
 
 		 567 aa  349  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  43.29 
 
 		 623 aa  349  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.42 
 
 		 602 aa  349  7e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.72 
 
 		 561 aa  349  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.95 
 
 		 604 aa  349  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.53 
 
 		 567 aa  349  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.02 
 
 		 565 aa  349  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.02 
 
 		 565 aa  349  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  36.52 
 
 		 630 aa  348  1e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.53 
 
 		 567 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.85 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 619 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.85 
 
 		 565 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.29 
 
 		 613 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.05 
 
 		 613 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.02 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  39.02 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.28 
 
 		 595 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.28 
 
 		 595 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.28 
 
 		 595 aa  347  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.42 
 
 		 616 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.06 
 
 		 611 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  38.36 
 
 		 603 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.78 
 
 		 642 aa  343  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 619 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.37 
 
 		 600 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.95 
 
 		 565 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  39.3 
 
 		 626 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  38.95 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.19 
 
 		 592 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 619 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  38.16 
 
 		 622 aa  341  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.51 
 
 		 610 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.94 
 
 		 613 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.62 
 
 		 565 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.68 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.68 
 
 		 616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.39 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  42.81 
 
 		 595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.58 
 
 		 592 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.69 
 
 		 583 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.99 
 
 		 624 aa  333  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  41.7 
 
 		 608 aa  332  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  41.28 
 
 		 605 aa  332  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  40.56 
 
 		 570 aa  331  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.08 
 
 		 628 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.74 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.23 
 
 		 591 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.45 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.89 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.04 
 
 		 583 aa  326  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  38.69 
 
 		 649 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  41.74 
 
 		 604 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  37.85 
 
 		 631 aa  324  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  40.56 
 
 		 603 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  41.77 
 
 		 591 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  34.66 
 
 		 577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.92 
 
 		 606 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.8 
 
 		 596 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  37.44 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>