More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4142 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 581 aa  1129    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  66.11 
 
 		 596 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  81.25 
 
 		 591 aa  862    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  53.67 
 
 		 603 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  52.43 
 
 		 602 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  52.86 
 
 		 600 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.88 
 
 		 607 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  46.08 
 
 		 616 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  42.44 
 
 		 605 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.15 
 
 		 810 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.54 
 
 		 789 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  42.63 
 
 		 589 aa  375  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.22 
 
 		 750 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.5 
 
 		 626 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  43.98 
 
 		 745 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  37.14 
 
 		 731 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  36.41 
 
 		 630 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  41.7 
 
 		 623 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.64 
 
 		 616 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.64 
 
 		 616 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.37 
 
 		 586 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.74 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  42.57 
 
 		 752 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  35.7 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.48 
 
 		 624 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.61 
 
 		 628 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  41.22 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  40.79 
 
 		 642 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  38.55 
 
 		 629 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.83 
 
 		 613 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  34.7 
 
 		 577 aa  332  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.2 
 
 		 602 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  36.41 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.74 
 
 		 609 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.29 
 
 		 611 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.66 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.35 
 
 		 610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.17 
 
 		 612 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.06 
 
 		 619 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  34.41 
 
 		 570 aa  320  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 624 aa  320  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.34 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  35.33 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.9 
 
 		 619 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  37.67 
 
 		 649 aa  317  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  39.45 
 
 		 577 aa  316  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  40.77 
 
 		 604 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.06 
 
 		 619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.9 
 
 		 619 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.44 
 
 		 613 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.68 
 
 		 613 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  37.65 
 
 		 654 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  32.67 
 
 		 575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.91 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.27 
 
 		 613 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  36.7 
 
 		 623 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  35.64 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 628 aa  309  9e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.26 
 
 		 592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  37.14 
 
 		 605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.52 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  39.34 
 
 		 608 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.67 
 
 		 606 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.1 
 
 		 590 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.9 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  37.21 
 
 		 623 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  41.94 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.51 
 
 		 612 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  42.12 
 
 		 589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.03 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.03 
 
 		 565 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.85 
 
 		 565 aa  303  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  35.21 
 
 		 603 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06980  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.89 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.89 
 
 		 563 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  41.34 
 
 		 639 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.85 
 
 		 565 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  35.85 
 
 		 565 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.55 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.1 
 
 		 590 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.87 
 
 		 565 aa  299  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.26 
 
 		 567 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.07 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.89 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.07 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.85 
 
 		 565 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.24 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.89 
 
 		 567 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  42.51 
 
 		 570 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.78 
 
 		 591 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.45 
 
 		 590 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.71 
 
 		 624 aa  296  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 		 608 aa  296  9e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  35.66 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.29 
 
 		 565 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.05 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.4 
 
 		 563 aa  295  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  35 
 
 		 583 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  34.95 
 
 		 626 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.27 
 
 		 631 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>