More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0123 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0135  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  68.05 
 
 		 596 aa  715    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4142  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  81.22 
 
 		 581 aa  834    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0123  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 		 591 aa  1143    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0310589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  54.02 
 
 		 603 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  53.38 
 
 		 602 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  52.51 
 
 		 600 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.62 
 
 		 616 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1074  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.53 
 
 		 607 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.58 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.89 
 
 		 810 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.73 
 
 		 789 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  39.76 
 
 		 750 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  37.96 
 
 		 630 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.07 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  44.67 
 
 		 745 aa  364  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  42.04 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.19 
 
 		 626 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.16 
 
 		 624 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  36.44 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  40.67 
 
 		 623 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  42.11 
 
 		 654 aa  350  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  39.15 
 
 		 629 aa  347  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  33.56 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  33.74 
 
 		 586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  41.3 
 
 		 752 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.17 
 
 		 642 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.51 
 
 		 616 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  39.51 
 
 		 616 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  37.28 
 
 		 625 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.23 
 
 		 613 aa  333  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.59 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  40.73 
 
 		 604 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  34.97 
 
 		 577 aa  323  7e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  33.21 
 
 		 575 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.38 
 
 		 602 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  37.77 
 
 		 605 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  39.93 
 
 		 608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  36.86 
 
 		 622 aa  320  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.48 
 
 		 628 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 		 624 aa  320  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  39.5 
 
 		 577 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  37.13 
 
 		 632 aa  317  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.99 
 
 		 610 aa  317  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.16 
 
 		 608 aa  315  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  41.75 
 
 		 639 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.98 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.64 
 
 		 609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  36.67 
 
 		 649 aa  314  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.92 
 
 		 592 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.27 
 
 		 604 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.02 
 
 		 563 aa  313  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.4 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.15 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.51 
 
 		 619 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.1 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.1 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.46 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  37.66 
 
 		 623 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.87 
 
 		 611 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.16 
 
 		 628 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.27 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 619 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  37.31 
 
 		 623 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.85 
 
 		 619 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.41 
 
 		 600 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.88 
 
 		 565 aa  309  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.95 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.78 
 
 		 565 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.57 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.68 
 
 		 619 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.95 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.37 
 
 		 612 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.66 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  35.66 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  35.7 
 
 		 565 aa  306  6e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.61 
 
 		 567 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.79 
 
 		 567 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.79 
 
 		 567 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.61 
 
 		 567 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  35.37 
 
 		 654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.51 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.51 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.51 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.79 
 
 		 567 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.2 
 
 		 624 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.31 
 
 		 565 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.22 
 
 		 583 aa  303  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.03 
 
 		 603 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.97 
 
 		 565 aa  301  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2760  thiol:disulfide interchange protein  41.71 
 
 		 589 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.7 
 
 		 583 aa  300  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32590  thiol:disulfide interchange protein  41.53 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426474  normal  0.0965179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  33.39 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.46 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2394  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.69 
 
 		 612 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000654714  hitchhiker  0.0000354348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.51 
 
 		 631 aa  298  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.31 
 
 		 590 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  34.99 
 
 		 626 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.41 
 
 		 572 aa  294  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  39.48 
 
 		 585 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>