More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0296 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  87.79 
 
 		 614 aa  1009    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  75.08 
 
 		 627 aa  840    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  75.08 
 
 		 627 aa  840    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  68.67 
 
 		 618 aa  811    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  74.76 
 
 		 627 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  74.56 
 
 		 627 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  92.22 
 
 		 617 aa  1072    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  99.02 
 
 		 611 aa  1200    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  73.11 
 
 		 627 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  69.8 
 
 		 631 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  68.94 
 
 		 626 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  91.71 
 
 		 615 aa  1075    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  92.2 
 
 		 615 aa  1066    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 611 aa  1211    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  74.92 
 
 		 627 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  91.71 
 
 		 615 aa  1075    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  75.08 
 
 		 627 aa  840    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  75.08 
 
 		 627 aa  840    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  49.11 
 
 		 624 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  47.93 
 
 		 649 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  49.92 
 
 		 639 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  49.83 
 
 		 608 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  47.4 
 
 		 586 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  49.5 
 
 		 605 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  47.99 
 
 		 623 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  47.99 
 
 		 604 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  43.91 
 
 		 613 aa  445  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  41.86 
 
 		 625 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  40.91 
 
 		 622 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.71 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  39.94 
 
 		 632 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.37 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  38.42 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  41.41 
 
 		 750 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.84 
 
 		 789 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.41 
 
 		 752 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  40.76 
 
 		 610 aa  395  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  41.28 
 
 		 623 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  41.82 
 
 		 642 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  42.07 
 
 		 648 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  42.88 
 
 		 645 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  38.55 
 
 		 654 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  35.8 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  40.82 
 
 		 745 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  36.7 
 
 		 586 aa  362  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  36.87 
 
 		 586 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.78 
 
 		 628 aa  360  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  39.71 
 
 		 623 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.02 
 
 		 626 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.37 
 
 		 589 aa  347  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.76 
 
 		 616 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.76 
 
 		 616 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.4 
 
 		 631 aa  344  4e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  36.22 
 
 		 629 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  35.29 
 
 		 575 aa  343  7e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  35.68 
 
 		 577 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.71 
 
 		 592 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.01 
 
 		 610 aa  329  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  33.72 
 
 		 570 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  37.33 
 
 		 603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 610 aa  327  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 613 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  37.79 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.72 
 
 		 619 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.39 
 
 		 619 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.71 
 
 		 608 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 		 613 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.79 
 
 		 613 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 		 619 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.39 
 
 		 619 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.97 
 
 		 624 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.97 
 
 		 607 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 611 aa  321  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.47 
 
 		 616 aa  319  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.65 
 
 		 590 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.19 
 
 		 609 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.19 
 
 		 583 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 595 aa  317  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 595 aa  317  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  34.05 
 
 		 589 aa  316  6e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.62 
 
 		 595 aa  317  6e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.9 
 
 		 602 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  35.73 
 
 		 557 aa  313  6.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.64 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.38 
 
 		 591 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  35.85 
 
 		 558 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.75 
 
 		 563 aa  308  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  37.48 
 
 		 590 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.82 
 
 		 563 aa  306  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  36.87 
 
 		 600 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.73 
 
 		 583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.94 
 
 		 592 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 		 565 aa  303  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 565 aa  302  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.84 
 
 		 565 aa  302  9e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.67 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  33.16 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>