More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0081 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  79.24 
 
 		 557 aa  885    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  100 
 
 		 558 aa  1125    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.32 
 
 		 624 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  36.83 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  35.06 
 
 		 626 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  34.46 
 
 		 611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  36.82 
 
 		 627 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.63 
 
 		 611 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  35 
 
 		 615 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  35 
 
 		 615 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.17 
 
 		 810 aa  325  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  34.4 
 
 		 617 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  35.38 
 
 		 614 aa  324  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  35.35 
 
 		 618 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  36.25 
 
 		 649 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.22 
 
 		 586 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.8 
 
 		 613 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  34.08 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.9 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.54 
 
 		 628 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.78 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.89 
 
 		 609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  34.98 
 
 		 631 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.56 
 
 		 613 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.83 
 
 		 602 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.56 
 
 		 619 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 619 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.9 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  34.79 
 
 		 642 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 619 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 		 619 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.96 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.28 
 
 		 610 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  35.1 
 
 		 622 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 		 611 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  32.62 
 
 		 630 aa  297  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  35.07 
 
 		 604 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.77 
 
 		 608 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.72 
 
 		 563 aa  293  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.17 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.53 
 
 		 600 aa  289  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.1 
 
 		 624 aa  289  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  32.01 
 
 		 750 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  33.06 
 
 		 629 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  33.5 
 
 		 610 aa  287  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.59 
 
 		 583 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.85 
 
 		 631 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.03 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.64 
 
 		 583 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.88 
 
 		 595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.88 
 
 		 595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.88 
 
 		 595 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33 
 
 		 565 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33 
 
 		 565 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.84 
 
 		 565 aa  283  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.78 
 
 		 789 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.76 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.76 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.93 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  31.28 
 
 		 623 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.76 
 
 		 567 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.44 
 
 		 632 aa  281  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.17 
 
 		 565 aa  280  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33 
 
 		 565 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.67 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.53 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.42 
 
 		 561 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.12 
 
 		 572 aa  274  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.95 
 
 		 624 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  34.87 
 
 		 623 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.96 
 
 		 589 aa  273  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  32.44 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  39.71 
 
 		 639 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  31.78 
 
 		 570 aa  267  4e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.4 
 
 		 624 aa  266  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  31.99 
 
 		 731 aa  265  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  30.49 
 
 		 589 aa  265  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.34 
 
 		 570 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  43.77 
 
 		 623 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.94 
 
 		 628 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  32.71 
 
 		 577 aa  257  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  31.62 
 
 		 574 aa  256  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  29.46 
 
 		 586 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  36.57 
 
 		 608 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.83 
 
 		 626 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.64 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  34.14 
 
 		 570 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  29.46 
 
 		 586 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  30.94 
 
 		 577 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.26 
 
 		 616 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.34 
 
 		 606 aa  243  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  31.67 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.47 
 
 		 654 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.16 
 
 		 611 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.03 
 
 		 563 aa  236  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>