More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0079 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0081  protein-disulfide reductase  79.24 
 
 
558 aa  874    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0079  Protein-disulfide reductase  100 
 
 
557 aa  1119    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000987227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  35.88 
 
 
605 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.4 
 
 
624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  35.08 
 
 
626 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  35.89 
 
 
611 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  35.28 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  35.93 
 
 
642 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.32 
 
 
586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.03 
 
 
810 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  36.88 
 
 
627 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  37.54 
 
 
649 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.03 
 
 
613 aa  317  5e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.32 
 
 
602 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  34.83 
 
 
618 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.63 
 
 
607 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.97 
 
 
628 aa  312  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  36.03 
 
 
608 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  36.73 
 
 
627 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.24 
 
 
604 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.23 
 
 
609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.14 
 
 
624 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.61 
 
 
608 aa  294  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.85 
 
 
563 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.38 
 
 
565 aa  293  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.38 
 
 
565 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.21 
 
 
565 aa  293  8e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  34.35 
 
 
731 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  32.67 
 
 
630 aa  292  1e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.38 
 
 
565 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  34.38 
 
 
565 aa  291  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.44 
 
 
567 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.05 
 
 
565 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.72 
 
 
567 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.56 
 
 
567 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.66 
 
 
565 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.11 
 
 
567 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.28 
 
 
567 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.1 
 
 
600 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.54 
 
 
632 aa  287  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.21 
 
 
565 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.12 
 
 
789 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.5 
 
 
565 aa  286  8e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2811  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.47 
 
 
624 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  33.22 
 
 
629 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.06 
 
 
595 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.06 
 
 
595 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.31 
 
 
595 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.71 
 
 
592 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  32.99 
 
 
603 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  31.68 
 
 
750 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.17 
 
 
619 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.17 
 
 
619 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  34.35 
 
 
622 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 
613 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.11 
 
 
619 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.17 
 
 
610 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.95 
 
 
619 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.22 
 
 
561 aa  276  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.8 
 
 
626 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.9 
 
 
583 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  34.49 
 
 
623 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.73 
 
 
592 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  32.83 
 
 
625 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  31.69 
 
 
570 aa  265  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  30.41 
 
 
586 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  39.81 
 
 
639 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.5 
 
 
583 aa  264  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  29.79 
 
 
582 aa  263  8e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3535  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.06 
 
 
572 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  32.43 
 
 
610 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.29 
 
 
570 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  33.66 
 
 
604 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  41.92 
 
 
623 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3936  protein-disulfide reductase  32.48 
 
 
577 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.327412  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  37.88 
 
 
631 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3559  protein-disulfide reductase  34.36 
 
 
570 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.65 
 
 
631 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  38.27 
 
 
615 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  38.27 
 
 
615 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 
616 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  37.91 
 
 
617 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.39 
 
 
611 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.66 
 
 
628 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  29.02 
 
 
574 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  31.13 
 
 
575 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  33.57 
 
 
449 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0712  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.86 
 
 
570 aa  246  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.642209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  37.91 
 
 
614 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  36.79 
 
 
615 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  33.1 
 
 
449 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.08 
 
 
654 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.92 
 
 
613 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  29.68 
 
 
589 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.92 
 
 
613 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  40 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.69 
 
 
611 aa  233  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0022  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.89 
 
 
614 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  40 
 
 
627 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40 
 
 
627 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>